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文檔簡介
1、MicroRNA(miRNA)是一類大小約為22個核苷酸的內源性短非編碼RNA,廣泛存在于動植物體內,通常結合機體內靶mRNA3'非編碼區(qū)(3'UTR)從而抑制mRNA的翻譯進而對基因表達起負調控作用。根據(jù)miRNA在基因組上與其它轉錄單位的位置關系,miRNA可分為基因間miRNA(intergenic miRNAs)和基因內miRNA(intragenic miRNA),而后者包括蛋白質編碼基因的外顯子或內含子miRNA。目前,盡管
2、在動物和植物中對miRNA功能研究已經(jīng)揭示的很清楚了,但對miRNA基因自身的轉錄了解仍十分有限,而對位于基因內的miRNA及其與宿主基因的轉錄關系,更是知之甚少。本實驗室前期對miR-135a在脂肪生成的作用和功能進行了探索研究,但miR-135a在脂肪生成過程中的本身轉錄機制并不清楚。因此,本研究采用生物信息學預測、啟動子雙熒光素酶報告基因載體、點突變、EMSA、ChIP、ChIP-qPCR、q-PCR和western blot等實
3、驗技術對miR-135a-1/2的轉錄機制進行了研究,主要研究結果如下:
1.miR-135a-1與miR-135a-2位于宿主基因內
根據(jù)NCBI網(wǎng)站比對發(fā)現(xiàn),mmu-miR-135a-1位于Chr9上Glyctk基因的第4或第5個外顯子區(qū),mmu-miR-135a-2位于Chr10上Rmst基因的第12個內含子區(qū)。由此表明miR-135a-1和miR-135a-2都是基因內miRNA。
2.基因內miR
4、-135a-1和miR-135a-2獨立轉錄
采用了生物信息學預測miR-135a-1/2上游潛在的啟動子,進而利用分段缺失構建啟動子雙熒光素酶報告基因載體,瞬時轉染到3T3-L1、C3H10T1/2和BHK三種細胞中,根據(jù)雙熒光素酶活性檢測確定核心啟動子片段。再用相應的生物學網(wǎng)站預測此片段中潛在的轉錄因子,構建點突變質粒,轉染到3T3-L1細胞中,鑒定是否為核心轉錄因子,進而用EMSA和ChIP試驗驗證轉錄因子與啟動子是否結
5、合。試驗結果表明,miR-135a-1上游(-1128~-557 bp)和miR-135a-2上游(-2264~-1733bp)分別為核心啟動子區(qū),并且轉錄因子STAT5a同時結合在此核心啟動子區(qū)域內。同時,點突變、EMSA和ChIP試驗結果得出STAT5a在細胞體外體內與核心啟動子結合。試驗證實,miR-135a-1/2并不隨著各自的宿主基因轉錄,而是具有自身的獨立轉錄本。
3.成脂轉錄因子STAT5a上調miR-135a表
6、達
構建STAT5a的超表達質粒,瞬時轉染到3T3-L1細胞中,檢測miR-135a及其靶基因APC的表達量。試驗結果表明,超表達STAT5a后,miR-135a的表達量上調,APC在mRNA水平上升但在蛋白水平下降。而干涉STAT5a后,miR-135a的表達量下降,APC在mRNA水平和蛋白水平上升。試驗表明,STAT5a上調miR-135a的表達。
4.轉錄因子STAT5a與miR-135a的靶基因APC存在一
7、個潛在的負反饋調節(jié)環(huán)路
為了探索轉錄因子STAT5a與miR-135a的靶基因APC之間的關系,本研究在超表達STAT5a的基礎上,誘導3T3-L1前脂肪細胞成脂肪細胞的過程中,檢測STAT5a和APC的表達情況。試驗結果得出,STAT5a和APC在mRNA水平和蛋白水平都呈現(xiàn)出此消彼長的趨勢,而miR-135a的表達與之前對miR-135a的功能研究結果一樣都是隨著脂肪細胞誘導加深表達量一直下降的。試驗結果顯示,在脂肪沉積過
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