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文檔簡介
1、目的:
分析系統(tǒng)性紅斑狼瘡(systemic lupus erythematosus,SLE)患兒與健康兒童外周血中干擾素調(diào)節(jié)因子5(interferon regulatory factor5,IRF-5)、IFN-α及Sp1基因的差異表達(dá);克隆人IRF-5的啟動(dòng)子并尋找其核心啟動(dòng)子區(qū)域;鑒定調(diào)控IRF-5的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子;探索組蛋白去乙酰化酶抑制劑(histone deacetylaseinhibitors,HDACi)及組蛋
2、白乙酰轉(zhuǎn)移酶(histone acetyltransferase,HAT)對IRF-5表達(dá)的影響及相關(guān)機(jī)制。
方法:
提取12例確診的SLE患兒及健康兒童的外周血單個(gè)核細(xì)胞,實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測IRF-5、IFN-α及Sp1的表達(dá);采用PCR方法獲取IRF-5基因5'側(cè)翼序列及一系列5'端缺失體,定向插入到pGL3-Basic載體中,雙螢光素酶報(bào)告基因檢測系統(tǒng)鑒定其啟動(dòng)子活性;TFSEARCH在線軟件及JASPAR
3、 database預(yù)測IRF-5核心啟動(dòng)子區(qū)域潛在的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),利用點(diǎn)突變技術(shù)、RNA干擾、轉(zhuǎn)錄因子過表達(dá)、凝膠遷移實(shí)驗(yàn)(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)及染色質(zhì)免疫沉淀(chromatin immunoprecitation,ChIP)等實(shí)驗(yàn),鑒定調(diào)控IRF-5的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子;觀察2種HDACi-曲古抑菌素A(trichostatin A,TSA)、丙戊酸鈉(valproic
4、acid,VPA)及2種HAT-P300、PCAF對IRF-5啟動(dòng)子活性、mRNA及蛋白表達(dá)的影響,利用酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)檢測TSA、VPA對受誘導(dǎo)的THP-1細(xì)胞上清液中IFN-α、TNF-α表達(dá)的影響,用ChIP-qPCR實(shí)驗(yàn)觀察TSA、VPA對Sp1、PolⅡ、HDAC3、P300及PCAF與IRF-5啟動(dòng)子區(qū)結(jié)合的影響。
結(jié)果:
1.SLE患兒中IRF-5、Sp1及IFN-α的表達(dá)較健康兒童升高55%、61%及
5、85%,Sp1、IFN-α的表達(dá)與IRF-5呈正相關(guān)(P<0.05)。
2.IRF-5一系列截短的質(zhì)粒螢光素酶活性分析顯示:從-1760 bp缺失到-179bp位后,仍具有較高的啟動(dòng)子活性,但從-179 bp位缺失到-40 bp位時(shí),啟動(dòng)子活性顯著下降,提示IRF-5核心啟動(dòng)子位于-179~+62bp區(qū)域。
3.生物信息學(xué)預(yù)測該區(qū)域包含了3個(gè)Sp1的結(jié)合位點(diǎn),點(diǎn)突變、RNA干擾、轉(zhuǎn)錄因子過表達(dá)、EMSA、ChIP及實(shí)
6、時(shí)熒光定量PCR等實(shí)驗(yàn)證明Sp1能與IRF-5的啟動(dòng)子區(qū)結(jié)合并正向調(diào)控IRF-5的表達(dá)。
4.TSA、VPA下調(diào)IRF-5的表達(dá)并抑制受誘導(dǎo)的THP-1細(xì)胞上清液中IFN-α、TNF-α的釋放,P300下調(diào)IRF-5的表達(dá),而PCAF對IRF-5的表達(dá)沒有影響,ChIP-qPCR實(shí)驗(yàn)檢測發(fā)現(xiàn)TSA及VPA抑制Sp1、PolⅡ、HDAC3、P300與IRF-5啟動(dòng)子區(qū)的結(jié)合,而對PCAF與IRF-5啟動(dòng)子區(qū)的結(jié)合沒有影響。
7、> 結(jié)論:
1.SLE患兒中IRF-5、Sp1及IFN-α的表達(dá)高于健康兒童,Sp1、IFN-α的表達(dá)與IRF-5呈正相關(guān),提示IRF-5可能參與兒童SLE的發(fā)病。
2.人IRF-5基因的核心啟動(dòng)子區(qū)域位于-179至+62 bp處,Sp1能夠正向調(diào)控IRF-5的表達(dá),從而為治療IRF-5基因相關(guān)的疾病提供靶點(diǎn)。
3.TSA、VPA下調(diào)IRF-5的表達(dá),并抑制IFN-α、TNF-α的釋放,P300能下調(diào)IR
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