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文檔簡(jiǎn)介
1、第一部分先天性全身毛發(fā)增多癥中6q22微重復(fù)的鑒定
先天性全身毛發(fā)增多癥(congenital generalized hypertrichosis,CGH)以非雄激素依賴的全身性毛發(fā)過(guò)度生長(zhǎng)為主要特征,具有表型異質(zhì)性及遺傳異質(zhì)性,臨床上分型較多,不同亞型之間表型有交疊。已發(fā)現(xiàn)的致病改變包括4號(hào)、8號(hào)、17號(hào)、X染色體重排,以及同樣位于17號(hào)染色體上的ABCA5基因點(diǎn)突變。
本研究收集一例CGH家系。先證者多毛表型接
2、近Ambras型,伴先天性視力不良及脊柱側(cè)彎,牙齒自30歲始至完全脫落,其雙親及同胞均表現(xiàn)正常。經(jīng)知情同意,采集先證者及其母親、所有四名同胞外周血或口腔上皮細(xì)胞,提取基因組DNA。微陣列比較基因組雜交(array comparative genomic hybridization,aCGH)分析發(fā)現(xiàn)先證者6q22存在兩個(gè)微重復(fù)(依次稱為Dup1與Dup2),經(jīng)實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(quantitive real-time poly
3、merase chain reaction,qPCR)驗(yàn)證在家系中與疾病表型共分離。隨后進(jìn)行一系列qPCR縮小兩個(gè)微重復(fù)邊界范圍,并嘗試多種gap-PCR組合方式最終克隆得到斷裂點(diǎn)。將gap-PCR產(chǎn)物進(jìn)行Sanger測(cè)序,結(jié)果顯示兩個(gè)微重復(fù)邊界彼此相連。結(jié)合雙色熒光原位雜交(fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)結(jié)果推斷重排后染色體結(jié)構(gòu)。重復(fù)區(qū)內(nèi)STR提示先證者微重復(fù)為父源新生重復(fù)。
4、 此兩個(gè)微重復(fù)中共包含6個(gè)基因,其中GJA1基因?yàn)檠埤X指發(fā)育不良(ODDD)的致病基因,其拷貝數(shù)改變可能是患者眼睛與牙齒表型的原因;RSPO3與RNF146基因的功能與調(diào)節(jié)毛囊周期的Wnt通路相關(guān),其拷貝數(shù)改變可能單獨(dú)或共同導(dǎo)致患者多毛的表型。
綜上所述,我們首次在CGH患者中發(fā)現(xiàn)6號(hào)染色體上的染色體重排,確定了重排后的染色體結(jié)構(gòu),并推測(cè)兩個(gè)微重復(fù)為父源新生重復(fù)。
第二部分Bazex-Dupre-Christol綜合
5、征中Xq26.1微重復(fù)的鑒定
Bazex-Dupre-Christol綜合征(Bazex-Dupre-Christol syndrome,BDCS)是一種極罕見(jiàn)的遺傳病,其主要臨床表現(xiàn)為一個(gè)先天性毛發(fā)稀少、毛囊性皮膚萎縮與早發(fā)性基底細(xì)胞癌(basal cell carcinomas,BCCs)的三聯(lián)征。該病表型輕重不一,且易與其他疾病混淆,因此需進(jìn)行嚴(yán)格的鑒別診斷。BDCS呈現(xiàn)明顯的X連鎖顯性遺傳模式,目前定位至Xq25-q2
6、7.1一個(gè)11.4Mb的范圍內(nèi),但該區(qū)域內(nèi)12個(gè)在毛囊中對(duì)細(xì)胞增殖分化起重要作用的候選基因中并未檢測(cè)到突變。
本課題組開(kāi)展BDCS相關(guān)工作初期收集到兩個(gè)歐洲BDCS家系,通過(guò)全基因組拷貝數(shù)變異(copy number variation,CNV)分析,在Xq26.1上發(fā)現(xiàn)一段兩家患者共享的重復(fù)區(qū),并經(jīng)qPCR驗(yàn)證在兩個(gè)家系中與疾病表型共分離。隨后,通過(guò)qPCR、gap-PCR及Sanger測(cè)序確定兩家的微重復(fù)范圍,其中家系2(
7、F2)精確至堿基水平,并推測(cè)了各自的重排機(jī)制。
為了進(jìn)一步探究該重復(fù)區(qū)域的致病性,本研究收集到另6個(gè)歐洲BDCS家系。本研究前期發(fā)現(xiàn)的微重復(fù)經(jīng)qPCR在其余6家患者中均得到驗(yàn)證,并結(jié)合gap-PCR及SNP位點(diǎn)擴(kuò)增測(cè)序的方法作為補(bǔ)充,確認(rèn)各家微重復(fù)在家系內(nèi)所有成員中均與疾病表型共分離。同時(shí),在215個(gè)歐洲無(wú)關(guān)對(duì)照人群,共計(jì)354條X染色體中未發(fā)現(xiàn)類(lèi)似的微重復(fù)。隨后,我們確定了新收集6家的微重復(fù)范圍,其中F4、F7、F9精確到堿
8、基水平,并推測(cè)了各自的重排機(jī)制。此外,我們還通過(guò)單體型分析,證明8家微重復(fù)為獨(dú)立發(fā)生。最后,我們構(gòu)建了Krt15組織特異性過(guò)表達(dá)的的轉(zhuǎn)基因小鼠模型,以期進(jìn)行相關(guān)的表型觀察與功能研究,但并未在預(yù)期的位置檢測(cè)到Igsf1的過(guò)表達(dá)。
綜上,我們提供了充分的證據(jù),從遺傳學(xué)層面說(shuō)明Xq26.1上的微重復(fù)很可能是BDCS的致病突變,但其具體致病機(jī)制有待進(jìn)一步研究。
第三部分常染色體顯性遺傳性稀毛癥致病突變鑒定
遺傳性稀
9、毛癥(hereditary hypotrichosis,HH)是一組臨床上較少見(jiàn)的疾病,既可單獨(dú)發(fā)生,也可合并其他表型發(fā)生?;颊咄ǔ3錾鷷r(shí)有頭發(fā),幾個(gè)月后開(kāi)始脫落,具有很強(qiáng)的臨床表型異質(zhì)性,可為全身受累(generalized)或頭皮受累(scalp-limited),伴有或不伴有毛干異常,以及毛囊發(fā)育異常等。同時(shí),該病也具很強(qiáng)的遺傳異質(zhì)性,主要為常染色體顯性(autosomal dominant,AD)與常染色體隱性(autosoma
10、l recessive,AR)。致病基因已知的ADHH按表型可分為三大類(lèi),第一類(lèi)為單純性遺傳性稀毛癥(hereditary hypotrichosis simplex,HSS),其中全身受累型的致病基因APCDD1、RPL21和SNRPE,頭皮受累型為CDSN;第二類(lèi)為Marie Unna型遺傳性稀毛癥(MarieUnna hereditary hypotrichosis,MUHH),其中1型的致病基因?yàn)閁2HR,2型為EPS8L3;第
11、三類(lèi)位羊毛狀發(fā)(woolly hair,WH),致病基因?yàn)镵RT74及KRT71。本研究收集三個(gè)ADHH家系(F1、F2、F3),分別對(duì)其進(jìn)行基因診斷與相關(guān)遺傳學(xué)研究。
在F1中,我們通過(guò)等位基因共享分析排除APCDD1、RPL21、CDSN、SNRPE,以及兩個(gè)KRT基因簇中的基因作為該家系的致病基因,最終在U2HR基因中檢測(cè)到c.82G>C(D28H)雜合突變作為致病突變,可為該家系后續(xù)的遺傳咨詢及產(chǎn)前基因診斷提供基礎(chǔ)。<
12、br> 在F2中,我們首先確認(rèn)了患病的父親攜帶U2HR基因c.2T>C(M1T)雜合突變;隨后胎兒經(jīng)Sanger測(cè)序并排除母源污染,確認(rèn)不攜帶此突變,不為患者。
在F3中,我們先對(duì)先證者進(jìn)行APCDD1和RPL21基因突變篩查,檢測(cè)到RPL21基因c.95G>A(R32Q)雜合突變,并在全部家系成員中驗(yàn)證,確認(rèn)為致病突變。隨后,通過(guò)與報(bào)道了相同突變的F4和F5共同進(jìn)行單體型分析,確認(rèn)三家突變?yōu)楠?dú)立發(fā)生,從而進(jìn)一步確認(rèn)RPL2
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