HepG2肝癌細(xì)胞及正常人肝細(xì)胞(Hl-7702)的microRNA-mRNA表達(dá)譜差異關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、MicroRNA(miRNA)和mRNA共同構(gòu)成了一個重要的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，在動物發(fā)育、細(xì)胞分化及代謝中起著重要的作用。復(fù)雜疾病的發(fā)生發(fā)展與microRNA（miRNA）有密切關(guān)系，研究miRNA與其靶基因（mRNA）在復(fù)雜疾病中的協(xié)同作用機制是一項具有挑戰(zhàn)意義的課題。近期的研究表明它們還與腫瘤的發(fā)生有著極其重要的關(guān)聯(lián)。本論文利用新一代高通量測序儀，對肝癌細(xì)胞HepG2和正常肝細(xì)胞HL-7702的miRNA和mRNA同時進(jìn)行全基因組表達(dá)譜

2、測序，通過生物信息學(xué)分析方法獲得miRNA和mRNA的表達(dá)譜數(shù)據(jù)，綜合利用靶標(biāo)預(yù)測以及各種基因表達(dá)譜的關(guān)聯(lián)分析手段，對兩種細(xì)胞的miRNA和mRNA進(jìn)行全基因組范圍的表達(dá)差異關(guān)聯(lián)分析，試圖更全面了解肝細(xì)胞與腫瘤細(xì)胞之間的與腫瘤發(fā)生、發(fā)展相關(guān)聯(lián)的miRNA和mRNA的參與通路情況，用以闡明miRNA調(diào)節(jié)各種基因的表達(dá)水平與腫瘤發(fā)生的關(guān)系，篩選特定miRNA作為腫瘤的早期診斷標(biāo)志物、惡性評估及預(yù)后的判斷指標(biāo)等，并可以用于篩選能夠控制瘤生長的

3、生物小分子藥物。本課題目前主要完成了以下幾點研究內(nèi)容:
　　1.本文對HepG2肝癌細(xì)胞和HL-7702肝正常細(xì)胞的miRNA進(jìn)行了表達(dá)譜差異分析。首先挑選出log2(fold-change)＞1或＜-1、p-value＜0.05的差異表達(dá)的miRNA。然后通過GO功能注釋發(fā)現(xiàn)在上下調(diào)的miRNA中均存在大量與細(xì)胞生長、細(xì)胞分化、細(xì)胞增殖、細(xì)胞死亡等生物過程相關(guān)。針對這些與細(xì)胞死亡、細(xì)胞分化等相關(guān)的miRNA進(jìn)一步分析，發(fā)現(xiàn)他們主

4、要在p53信號通路、Rb信號通路、經(jīng)典Wnt信號通路等發(fā)揮作用。
　　2.本文對HepG2肝癌細(xì)胞和HL-7702肝正常細(xì)胞的mRNA進(jìn)行了表達(dá)譜差異分析。首先挑選出log2(fold-change)＞1或＜-1、p-value＜0.01的差異表達(dá)的mRNA。然后進(jìn)行功能注釋發(fā)現(xiàn)大量與細(xì)胞增殖、細(xì)胞死亡等相關(guān)的基因。
　　3.本文基于以上miRNA和mRNA差異表達(dá)分析結(jié)果，發(fā)展了一種綜合利用靶標(biāo)預(yù)測及各種基因表達(dá)譜的關(guān)聯(lián)分