竹亞科轉(zhuǎn)座子的克隆及特征分析.pdf

1、上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文竹亞科轉(zhuǎn)座子的克隆及特征分析姓名：周明兵申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專業(yè)：@指導(dǎo)教師：唐克軒201009(DQ528658—DQ528739)，證明了轉(zhuǎn)座子在竹亞科廣泛分布并大量存在，具有高異質(zhì)性，類型豐富等特點(diǎn)。大部分竹亞科轉(zhuǎn)座子起源古老，祖先在竹亞科從禾本科分化出之前，即65百萬(wàn)年前就已經(jīng)存在。另外，一些轉(zhuǎn)座子分布雖然與竹種進(jìn)化不一致，但與它們宿主的地理分布是一致的，這暗示了自然分布在相鄰狹小區(qū)域的竹種有可能通過(guò)橫向傳

2、遞進(jìn)行了基因(轉(zhuǎn)座子)交流，影響了轉(zhuǎn)座子在竹亞科的分布。2)在竹亞科69個(gè)竹種克隆到79個(gè)尬E轉(zhuǎn)座酶全長(zhǎng)(叫101484蹦101562)，78個(gè)轉(zhuǎn)座酶具有完整的DNA結(jié)合域和催化域。DNA結(jié)合域具有典型的螺旋一拐角螺旋(HTH)結(jié)構(gòu)，催化域具有典型的DD39D保守域。所克隆的轉(zhuǎn)座酶同源性高，沒(méi)有明顯的移碼、插入／缺失和無(wú)義突變，表明它們可能是_坦壓轉(zhuǎn)座子最近一次橫向傳遞的產(chǎn)物。通過(guò)多態(tài)性分析，發(fā)現(xiàn)來(lái)自橄欖竹似c洳s以s口舀弘療加刀)的轉(zhuǎn)

3、座酶與79個(gè)尬E轉(zhuǎn)座酶的同源序列完全一致。通過(guò)酵母表達(dá)體系鑒定，該轉(zhuǎn)座子傾向于插入到TA位點(diǎn)上，在插入位點(diǎn)會(huì)留下TA靶向重復(fù)序列。這些結(jié)果表明，來(lái)自橄欖竹的轉(zhuǎn)座子似緲口，J『)是一個(gè)具有天然轉(zhuǎn)座活性的尬E轉(zhuǎn)座子。3)通過(guò)改良型基因組步行法克隆到毛竹兩個(gè)尬E轉(zhuǎn)座子全長(zhǎng)(砌，，z甜J，蹦581665和舶聊甜2，刪581666)，這兩個(gè)轉(zhuǎn)座子都具有完整的轉(zhuǎn)座酶結(jié)構(gòu)，典型的』坦壓轉(zhuǎn)座子末端顛倒重復(fù)序列和典型的TA靶向重復(fù)序列。利用轉(zhuǎn)座子展示技術(shù)