德國鏡鯉與黑龍江野鯉雜交組合的親子鑒定及鯉魚免疫功能基因SNP位點研究.pdf

1、一、德國鏡鯉與黑龍江野鯉雜交組合的親子鑒定
　　利用微衛(wèi)星多態(tài)性進行魚類親子鑒定,在魚類選育中具有重要意義。本研究采用8個微衛(wèi)星標記對黑龍江野鯉♀×德國鏡鯉♂(正交組合),及德國鏡鯉♀×黑龍江野鯉♂(反交組合)進行親子鑒定。結果顯示:(1)正交組中父母本和子代觀測雜合度分別為0.6071、0.7143和0.6818,多態(tài)信息含量依次為0.4421、0.2813和0.5535;反交組中父母本和子代觀測雜合度分別為0.7083、0.5

2、386和0.7438,多態(tài)信息含量依次為0.6735、0.3759和0.6241,表明8個位點具有較高的多態(tài)性。(2)正交組中,8個位點累計排除率為99.92％,親本與子代的配對率98.00%(置信度為95%);反交組中,8個位點累計排除率為99.99%,親本與子代的配對率99.00%(置信度為95%)。(3)關于使用微衛(wèi)星標記數(shù)與鑒定率的探討,對3、4、5、6、7、8個微衛(wèi)星標記時的累計排除率和親子配對率比較,結果表明,正反交組分別利

3、用6和8個多態(tài)性良好的引物就能正確鑒定。
　　二、鯉魚免疫功能基因 SNP位點的研究
　　研究表明,11個鯉魚免疫功能基因中有4個具有SNP。為此,做了進一步的SNP多態(tài)性研究。
　　1.11個基因 SSCP結果
　　對 TLR2、TLR3a、TLR3b、TLR7a、TLR7b、TLR9、I型 IFN、TRAF6、IL-1β、MyD88a、MyD88b11個基因進行8個鯉魚群體292個個體 SSCP檢測。結果 T

4、LR2、TLR3a、TLR3b、TLR7a、TLR7b、I型 IFN、TRAF6無 SNP位點。IL-1β、TLR9、MyD88a、MyD88b基因多態(tài)性較高。
　　2. IL-1β基因
　　IL-1β基因在8個群體292個個體中共檢測出13個變異位點,占整個片段長度的2.41%,其中3個為非同義突變。用NJ法進行8個群體的個體聚類,得出的結論是松浦鏡鯉、松荷鯉及黑龍江野鯉大部分個體首先聚在一起,其次與松浦鯉,德國鏡鯉成活組

5、及德國鏡鯉死亡組聚在一起,最后再與易捕鯉、大頭鯉聚在一起。根據(jù)遺傳距離的進行的種群聚類分析的結果與個體聚類分析的結果大致相同。
　　3. TLR9基因
　　TLR9基因在292個個體中共檢測出37個變異位點,其中20個變異位點引起氨基酸的變化。c.988C>T、c.1237T>C、c.1700T>A、c.1770A>G、c.2278T>C、c.2307T>C、c.2377A>G、c.2547A>T、c.2580T>A、c.2