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文檔簡介
1、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文小麥EST標(biāo)記的開發(fā)及其應(yīng)用研究姓名:梅銘鳳申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師:馬正強20060701DEVELOPMENrOFESTM隨皿KERINWHEATANDTHEIRAPPLICATIONSABSTRACTneincreasingavailabilityofexpressedsequencetagstESTs)providesaninvaluableresourceofESTmarke
2、rs11heESTsencodingtranscriptionusedinthisstudyineluded161ESl飛withSSRdownloadcdfromnEC(IntemationaiTriteaceESTCooperation)and237ESTsfromcDNAHbrariesofSumaiNo3spikesinoculatedby只gramineagumdownloadedfromNCBIServe357EsTS鴨pr
3、imersweredesignedneprimersincluding161ES■SSRand357ES■STSwerethensurveyedforpolymorphismbetweenNanda2419andWangshuibaiFfftys/xlodECS謝tedfrom56polymorphicmarkerswercaddedtothegeneticmapofrecombinantinbredline(RIL)populatio
4、nofNanda2419xWingshuibaiconstructedbyLineta1(2004)161ESTSSRprimerswereaisosurveyed幻rpolymorphismbetweenOpataandW7984theparentof11MIpopulationTwentyonePOlymorphicESTSSRmarkerswereidenti丘edandweremappedonthispopulationByus
5、ingthenumberofdiseasedspikeletstWDS)andthelengthofdiseaserachides(U)R)asthetypeIIresistanceindex,twelveESTmarkersshowingassociationwithtypeIIresistancewereidentifiedintheNanda2419xWangshuibaipopulationthronghonewayANO踢an
6、alysisfourofwhichweremappedtotheQTLregiononchromosome6BreportedbyIJneta1(2004),andthreeofwhichweremappednearbytheQTLregioilsonchromosome6Band3BSixESTmarkersshowingassociationwithtypelresistancewereidentifiedusingtheperce
7、ntageofinfectedspikes∞IS)asthetypeIresistanceindexTwoofthemweremappedtotheOTLre百onoilchromosome2DreportedbyLincta1(2006),onewasmappednearbytheQTLregionOllchromosome4BElevenoftheESTmarkersassociatedwithFHBresistancewerese
8、lectedforexpressionanalysisbyusingcDNAfromspikesof砧sistuntcultivar‘w觚gshuibai’andsusceptiblecultivar‘Nanda2419’harvestedOh6h12h,24h,and48hafterinocalationwithFgraminearumThcresultsshowedthatallbutMAG2053wereinducedbyEgra
9、minearuminfectionFourESTsshowedthesameexpressionpatternbetweentheresistantandsusceptiblecultivars,andsixshoweddifferentiaexpressionpatternsbetweenthemhadditionninegenomicSSRmarkersweredevelopedandmappedusingCSnulli—te托嬲o
10、miclinesandtheRILpopulationofNanda2419xWangshuibaiInordertoidentifvandexploitbeneficialgenesineinkomwheat35einkomwheataccessionsthreetetrHoidwheatlinesandonecomm佃wheatwerecharacterizedfortheirgeneticdiversityusing33ESTSS
11、Rmarkersand41genomeDNAderivedSSRmarkersthatlocatedontheAgenomeofcomnlonwheatTheresultshowedth她atotalof33primersdetectedpolymorphismamongthe35einkomaccessionsand211allelesweredetectedwithanaverageof603allel%perlocusUPGMAa
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