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文檔簡介
1、目的:
本課題旨在探討TET1酶催化的核酸堿基的羥基化的化學機制,并研究9種中藥小分子對其調(diào)控作用。
方法:
本課題以Fe2+和α-KG依賴的TET1酶為研究對象,分別以5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)、苯、甲苯、DMSO、d6-DMSO為底物;H2O、H2O18、18O2、D2O為反應(yīng)體系,通過GC-MS,UPLC-MS檢測方法探索TET1酶促核酸堿基羥基化的機制及羥基化產(chǎn)物·O
2、H中的O、H的來源。并用GC-MS檢測方法檢測原花青素(Proanthocyanidin,PC)、蟛蜞菊內(nèi)酯(Wedelolactone)、丹酚酸B(Salvianolic acid B)、槲皮苷(Quercetin-3-rhamnoside)、黃芩苷(Baicalin)、7,8-二羥基黃酮(7,8-dihydroxyflavone)、木犀草素(Luteolin)、氯化矢車菊素(Cyanidin Chloride)、花旗松素(Taxif
3、olin)9種中藥小分子化合物與5mC反應(yīng)后在N-甲基-N-三甲硅基三氟乙酰胺(N-Methyl-N-(trimethylsilyl)trifluoroacetamide,MSTFA)衍生化試劑作用下產(chǎn)生的5hmC水平。
結(jié)果:
結(jié)果顯示:通過GC-MS檢測到TET1酶催化5mC羥基化產(chǎn)物5hmC。TET1酶催化苯并未產(chǎn)生羥基化產(chǎn)物苯酚的分子離子峰(m/z94)。甲苯、DMSO、d6-DMSO在TET1酶催化作用下分
4、別產(chǎn)生羥基化產(chǎn)物苯甲醇(m/z108),C2H68O2(m/z94),C2D68O2(m/z100)。在H2O18、18O2的反應(yīng)體系中,檢測到TET1催化5mC的羥基化產(chǎn)物C5H7N3OO18,而在D2O的反應(yīng)體系并未檢測到C5H6N3O2D。中藥小分子與5mC以1∶10摩爾比反應(yīng)時,原花青素、蟛蜞菊內(nèi)酯、丹酚酸B、黃芩苷、槲皮苷、7,8-二羥基黃酮、木犀草素、氯化矢車菊素、花旗松素、9種中藥天然活性成分對TET1酶催化5mC產(chǎn)生5h
5、mC峰面積分別為1053811,842578,794099,1277581,640249,555535,408748,0。
結(jié)論:
第一,TET1酶促5mC羥基化產(chǎn)生5hmC。TET1催化核酸堿基羥基化過程是從底物中的-CH3抽H原子,隨后H原子與TET1結(jié)合成·OH,羥基再“反彈”(Rebound)到底物-CH2。在此過程中,·OH中的H來源于底物中的-CH3上的H,并非來源H2O中的H。而·OH中的O可能是來源于
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