10273.核酸堿基與甘氨酸二肽間氫鍵作用的最佳位點

1、分類號：密級：學校代碼：學號：10165201311000932逢掌師筢大學碩士學位論文核酸堿基與甘氨酸二肽間氫鍵作用的最佳位點作者姓名：刻揚學科、專業(yè)：塹理焦堂研究方向：僉王遮鹽量搓拯導師姓名：董鍪墓三籃生2016年O5月遼寧師范大學碩士學位論文摘要研究核酸堿基與蛋白質多肽間的氫鍵作用位點對深入認識核酸與蛋白闖的相互作用機制，進而有效設計合成新型生物分子材料有重要指導價值本文使用B3LYP／6—31G(識功方法優(yōu)化得到了堿基腺嘌呤、胸

2、腺嘧啶、尿嘧啶、鳥嘌呤及胞嘧啶與甘氨酸二肽分子形成的46個氫鍵復合物的穩(wěn)定結構，并使用包含BSSE校正的MP2／augccpVTZ方法計算了各復合物的結合能研究工作主要可歸納為如下幾個方面：1探討了五種堿基分子與甘氨酸二肽分子之間氫鍵作用的最佳位點研究結果表明，每種堿基均可通過多個位點與甘氨酸二肽分子形成氫鍵復合物，腺嘌呤、胸腺嘧啶、尿嘧啶、鳥嘌呤及胞嘧啶分別最傾向通過A3、T1、U1、G3及c1位點與甘氨酸二肽分子形成氫鍵復合物；甘氨

3、酸二肽可通過主鏈處的兩種位點(Gly5位點與Gly7位點)分別與五種堿基形成氫鍵復合物，通過Gty5位點時與各堿基形成的復合物更為穩(wěn)定2探究了質子化反應和去質子化反應焓變與氫鍵強度的關聯(lián)研究結果表明，堿基分子與甘氨酸二肽同一位點相互作用時，堿基分子某位點處的質子化反應焓變值越負所形成的氫鍵復合物越穩(wěn)定，去質子化反應焓變值越低所形成的氫鍵復合物越穩(wěn)定由氫鍵復合物結合能計算所得的穩(wěn)定性次序與由堿基分子質子化和去質子化反應焓變值推測所得的穩(wěn)定