rv野毒株l基因c端339;race擴(kuò)增及序列分析

1、吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文RV野毒株L基因C端3'-RACE擴(kuò)增及序列分析姓名：郭利申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：預(yù)防獸醫(yī)學(xué)指導(dǎo)教師：錢愛(ài)東20060501A m p l i f i c a t i o n C a r b o - t i p o f L G e n e B y 3 ’- R A C E A n d S e q u e n c eA n a l y s i s o f R a b i e s V i r u sA b s

2、 t r a c tR a b i e s i s ak i n do fz o o n o t i cv i r a ld i s e a s ew h o s ea p p e a r a n c eh a sb e e n n o t a b l et h r o u g h o u tr e c o r d e dh i s t o r y ．I t i s t h em o s t p o p u l a ra n dm o

3、s t s e v e r e s ti n f e c t i o nd i s e a s ei n t h ew o r l d ．W H O r e p o r t e dt h a t t h e r ea r e3 5 ，0 0 0 - 7 0 ，0 0 0d e a t h se a c hy e a rw o r l d w i d e ．A n d t h el o s s e so fd o m e s t i ca

4、 n i m a la n do t h e ra n i m a ld e a t h s a r e u n a b l e t o e s t i m a t e ．I n r e c e n t y e a r s a l o n g w i t h m o l e c u l a r b i o l o g y a n di m m u n o l o g yd e v e l o p m e n ta n da p p l

5、i c a t i o n ，w ek n o wa l l a s p e c t so fr a b i e s v i r u s ，s u c h a s v i r u s s t r u c t u r e ，t h eg e n es e q u e n c ea n d i t s t h em a i nf u n c t i o na n d s oo n ．I nt h i ss t u d y ，t h ee D

6、 N A f r a g m e n t so fL g e n e5 ’t e r m i n a lo ft w o r a b i e sv i r u ss w a i n si nJ i l i na n dH e n a n w e r ec l o n e da n ds e q u e n c e dw i t hm e t h o d o fR T - P C Ra n d3 ' - R A C E ．T h

7、e n u c l e o f i d e s s e q u e n c e a n dd e d u c e da m i n oa c i d s e q u e n c e o f t h e s e c D N Af i g m e n t sm e n t i o n e da b o v e w e r ed i v i d e di n t ot w of r a c t i o n s ．O n ei s c a r

8、b o n p a r t o fLg e n e ，t h e o t h e ri s 5 ’t e r m i n a l ( N C S ) ．a(chǎn) n dt h e y w e r ec o m p a r e dw i t l l o t h e r r a b i e s ·r e l a t e d v i r u ss t r a i n sp u b l i s h e di n N C B Ip r e v

9、 i o u s l y ．T h er e s u l ts h o wt h a tt h eh o m o l o g y o fn u c l e o t i d es e q u e n c ea n da ／／1 i 1 1 0 a c i ds e q u e n c eo fc a r b o np a r ti nL g e n ea m o n gt h e s et w or a b i e sv i r u ss

10、 t r a i n s i s9 1 ．3 ％a n d 9 5 ．8 ％．a(chǎn) n dt h e s et W O s t r a i n sb e l o n gt ot y p eo fg e a e I ．A n dc o m p a r i s o no ft h en u c l e o t i d es e q u e n c eo fL g e n e5 ’t e r m i n a lf o rd e e p r e

11、s e a r c h ．I ts h o w st h a t t h el o w e s th o m o l o g y a m o n g t h e s er a b i e sv i r u ss t r a i n s i sD R V 8 2 0 2 a n dM R V ，t h e h o m o l o g yi s6 4 ．8 ％．S t a t i s t i c so fe a c hk i n do fb

12、 a s i cg r o u p o fN C S i n d i c a t et h a tt h ec o n t e n t so f G + C ％a r ea l lt a l l e rt h a n3 8 ．8 9 ％．c o n t e n t so fG + C ％i nD R V 8 2 0 2i s5 I ．8 5 ．a(chǎn) n d4 2 ．9 5 ％i n M R V ．B u te a c hk i n do

13、fb a s i cg r o u pc o m p o s i t i o n c o n t e n t i sd i f f e r e n c e ．M o s to fa m i n o a c i da r eb a s i ca m i n o a c i d i nL P ，t w od o m a i n s i nL P a r e h y & o p h o b i cr e g i o n ( b es

14、i t u a t e d a t 8 5 1 - 8 6 9a n d 1 9 6 2 —1 9 8 0 ) ，t h e ym a y b ep a r t i c i p a t e i ni n t e r a c t i o no fL P a n dN 、M 1 。T h r o u 【g hc o m p a r i s o n ，M e t i s m u t a t e d i n t oV a t a tt h es

15、 i t e o f8 5 6i n t h eD R V 8 2 0 2 s t r a i n ，A l a i sm u t a t e d i n t oS e r a tt h e s i t eo f 1 9 7 1i nt h e M R V s t r a i n ．t h e r e a l e n o tm u t a t i o n si no t h e ra m i n o a c i d s ．K e y w