豬疥螨副肌球蛋白基因的擴(kuò)增及序列分析.pdf

1、豬疥螨病則豬常見(jiàn)的多發(fā)性寄生蟲(chóng)病，主要引起豬劇癢、疼痛、結(jié)痂而導(dǎo)致生長(zhǎng)停滯，迅速消瘦。本病傳播快、流行廣、發(fā)病重劇，對(duì)養(yǎng)豬業(yè)危害極大。長(zhǎng)期以來(lái)，動(dòng)物疥螨病的防治均以藥物殺螨為主，但殺螨藥物均不同程度地存在副作用且長(zhǎng)期使用可能產(chǎn)生抗藥性以及造成環(huán)境污染等問(wèn)題，因此需要進(jìn)行防治新技術(shù)的研究。目前有關(guān)豬疥螨病的免疫防治，尚無(wú)研究報(bào)道。
　　 根據(jù)GenBank中報(bào)道的紅狐疥螨蟲(chóng)株和兔疥螨蟲(chóng)株的副肌球蛋白基因全序列設(shè)計(jì)合成1對(duì)特異性引物

2、，首次擴(kuò)增出豬疥螨副肌球蛋白基因的全序列，經(jīng)測(cè)序并進(jìn)行生物信息學(xué)和系統(tǒng)發(fā)生分析。結(jié)果表明，豬疥螨副肌球蛋白基因全長(zhǎng)2628bp，GenBank登錄號(hào)為EU606031，其中A、T、C和G的含量分別為37.2％、20.7％、18.6％、23.5％，A+T含量(57.9％)高于G+C含量(42.1％)。核苷酸同源性分析表明，3個(gè)疥螨分離株間同源基因的相似性均較高(99.5％～99.9％)，其中分離自豬和紅狐的疥螨同源基因的相似性最高(99.

3、9％)，以分離自紅狐的疥螨與分離自兔的疥螨同源基因相似性最低(99.5％)。測(cè)定的豬疥螨蟲(chóng)株與其他科的螨蟲(chóng)同源基因相似性比較發(fā)現(xiàn)，與熊貓足螨(EU543652)間相似性最高(83.0％)，與牛足螨(EF053124)、綿羊癢螨(AM114275)間相似性次之(82.7％)，與刺翼塵螨(AY189697)間的相似性較高為82.0％，與熱帶無(wú)爪螨(AF525465)的相似性最低(78.4％)。氨基酸同源性也表現(xiàn)出相似的結(jié)果；而它們之間推導(dǎo)的

4、氨基酸同源性分析發(fā)現(xiàn)，3個(gè)疥螨分離株間同源氨基酸的相似性均較高(99.7％～99.9％)，其中以分離自豬和兔的疥螨同源氨基酸的相似性最高，以分離自紅狐的疥螨與分離自兔的疥螨同源基因相似性最低；測(cè)定的豬疥螨蟲(chóng)株與牛足螨(EF053124)、熊貓足螨(EU543652)間的同源氨基酸相似性分別為95.1％和95.3％；與綿羊癢螨(AM114275)間的同源氨基酸相似性為95.5％；與刺翼塵螨(AY189697)的同源氨基酸相似性較高為94.

5、3％；與熱帶無(wú)爪螨(AF525465)的同源氨基酸相似性較高為88.8％。
　　 生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)，豬疥螨副肌球蛋白全基因共編碼875個(gè)氨基酸，其中以谷氨酸、亮氨酸和賴氨酸的含量最高，而半胱氨酸、脯氨酸和色氨酸的含量最少；該蛋白分子理論值為102.383KD，其理論等電點(diǎn)pI=5.59，具有較強(qiáng)的親水性，蛋白抗原性分析顯示其抗原位點(diǎn)分布于整個(gè)蛋白質(zhì)多肽鏈，有29個(gè)T淋巴細(xì)胞抗原決定簇位點(diǎn)，不存在跨膜結(jié)構(gòu)域，是一種膜外蛋白，該蛋