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文檔簡介
1、本研究設(shè)計7對PCR套式引物，應(yīng)用RT-PCR方法及RACE末端擴增法，分片段擴增了豬戊型肝炎病毒甘肅省分離株swCH189全基因組序列。swCH189基因組長為7284nt，GenBank登錄號FJ610232，除3’端poly（A）尾外，基因組長為7171nt，共有3個ORFs，ORF1長5124bp，編碼1708aa。ORF2長2025bp，編碼674aa，ORF3長345bp，編碼114aa。其基因組結(jié)構(gòu)特征與HEV基因Ⅳ型一致
2、。HEVswCH189株與其他毒株全基因組序列核苷酸同源性為73.7%～89.6%；ORF2核苷酸同源性為79.1%～91.8%. swCH189株ORF1與已報道的Ⅰ～Ⅲ型毒株的ORF1氨基酸同源性為78.8%～86.9%，而與Ⅳ型毒株的同源性達(dá)93.7%～97.6%。swCH189株ORF2與已報道的Ⅰ～Ⅲ型毒株的氨基酸同源性為87.5%～92.4%，與Ⅳ型毒株的同源性為95.9～98.2%。swCH189株ORF3與已報道
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