野禽源AIV PB1-F2基因的克隆與遺傳進(jìn)化及部分氨基酸位點(diǎn)分析.pdf_第1頁(yè)
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1、選取14株野禽源AIV,以新近發(fā)現(xiàn)的A型流感病毒蛋白PB1-F2為研究對(duì)象,在完成此14株AIV PB1-F2基因克隆、測(cè)序的基礎(chǔ)上,對(duì)其進(jìn)行了同源性、遺傳進(jìn)化關(guān)系及氨基酸編碼特征的比較分析。我們發(fā)現(xiàn)H5N1亞型高致病性毒株A/lesser_kestrel/Harbin/194/2007(H5N1)PB1-F2的第37、48、50位氨基酸分別為精氨酸(Arg,R)、脯氨酸(Pro,P)、甘氨酸(Gly,G),與其它13個(gè)低致病性毒株均不

2、相同,其分別為谷氨酰胺(Gln,Q)、谷氨酰胺(Gln,Q)、天冬氨酸(Asp,D)。為探討這一現(xiàn)象,也為了使我們的研究更加全面、深入,從NCBI Influenza Virus Resource中選取1061個(gè)AIV毒株的PB1-F2基因序列進(jìn)一步展開(kāi)分析,結(jié)果表明所有非H9N2亞型AIV:97香港H5N1、其它H5N1及其它亞型AIV在此三個(gè)位點(diǎn)上的氨基酸構(gòu)成存在著較為明顯的差異,而且還呈現(xiàn)出了一定的規(guī)律和特點(diǎn);H9N2亞型毒株:表

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