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文檔簡介
1、虎紋蛙病毒(tiger frog virus,TFV)是虹彩病毒的一種,也是養(yǎng)殖虎紋蛙蝌蚪和中華鱉發(fā)病致死的主要病原之一,本實驗在已完成虎紋蛙病毒的全基因組測序的基礎(chǔ)上,對其ORF10和ORF80蛋白進行相互作用蛋白相關(guān)、凋亡相關(guān)以及毒力相關(guān)方面進行了研究。 本試驗先從虎紋蛙病毒各基因的生物信息學(xué)分析以及實驗室已有基礎(chǔ)入手,篩選出虎紋蛙病毒的orf10與orf80基因作為研究對象。據(jù)核苷酸和蛋白質(zhì)序列比對分析,ORF10沒有任何
2、同源的相似序列和保守結(jié)構(gòu)域,而且根據(jù)本實驗室初步的基因芯片分析與半定量RT-PCR結(jié)果發(fā)現(xiàn)其基因在TFV感染宿主后有大量表達;而ORF80蛋白則含有一個與脂多糖誘導(dǎo)的腫瘤壞死因子a因子(LPSinduced TNF-a factor,LITAF)膜結(jié)合基序非常相似的結(jié)構(gòu)域,即N端的CXXC結(jié)構(gòu)域,中間由幾十個氨基酸所組成的長的疏水區(qū)再加上C端的(H)XCXXC結(jié)構(gòu)域。為進行蛋白相互作用方面的研究,將orf10和orf80基因克隆至原核表
3、達載體并誘導(dǎo)表達和純化,成功制備了抗ORF80蛋白的小鼠抗體,通過蛋白沉降、免疫沉淀和Far-Western Blot等方法檢測了與TFV ORF80蛋白相互作用的蛋白。為了研究這兩個基因?qū)毎蛲龅挠绊懀瑢苫蚩寺≈琳婧吮磉_載體并轉(zhuǎn)染至 FHM(fathead minnow)細胞,通過凋亡染色與細胞計數(shù),結(jié)果顯示ORF80蛋白的單獨表達會導(dǎo)致比較明顯的宿主細胞凋亡,而ORF10則不會引起細胞凋亡,這說明ORF80與細胞凋亡的誘導(dǎo)產(chǎn)生
4、相關(guān)。為了鑒定兩基因的表達對TFV毒力的影響,在FHM細胞中進行RNA干擾實驗,轉(zhuǎn)染針對兩基因的特異的siRNA后進行TFV感染,發(fā)現(xiàn)ORF10被抑制后能夠明顯抑制TFV引發(fā)的細胞病理變化,而ORF80被抑制則沒有這種效果,說明orf10基因是TFV毒力相關(guān)的重要基因。本文通過相互作用蛋白篩選、細胞凋亡誘導(dǎo)的鑒定以及毒力相關(guān)RNA干擾抑制的鑒定三個方面對TFV ORF10和ORF80的功能進行了初步研究,為。TFV侵染過程中引起的細胞凋
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