白樺4CL與CCoAOMT基因表達(dá)分析及蛋白預(yù)測.pdf

1、4-香豆酸輔酶A連接酶(4CL)是苯丙氨酸途徑中的關(guān)鍵酶。在苯丙氨酸途徑中，4CL是聯(lián)系木質(zhì)素前體和各個分支反應(yīng)的紐帶，分別催化4-香豆酸、咖啡酸、阿魏酸和芥子酸生成相應(yīng)的CoA酯，促進木質(zhì)素單體的合成。CCoAOMT慘與木質(zhì)素生物合成中的芳香環(huán)上的羥基的甲基化，既可以將咖啡酰輔酶A甲基化形成阿魏酰輔酶，也可以催化5-羥基阿魏酰輔酶A形成芥子酰輔酶A。PAL是苯丙烷類代謝途徑的第一個酶，催化苯丙氨酸脫氨形成肉桂酸，再轉(zhuǎn)化生成其他酚類酸（

2、香豆酸、咖啡酸）、酚類酯、酚類酸衍生物（水楊酸、五倍子酸）、香豆素、類黃醇和其它苯丙烯酸類衍生物。
　　本論文主要針對白樺4CL、CCoAOMT及PAL的結(jié)構(gòu)功能及表達(dá)特征進行分析，具體包括以下幾方面內(nèi)容:
　　(1)利用改良的CTAB方法成功提取質(zhì)量較好，純度高，白樺木質(zhì)部、葉片、雌花、雄花等部位總RNA，可以用作進一步的分子生物學(xué)研究。
　　(2)利用RT-PCR和RACE法獲得了白樺4CL2基因cDNA(命名為4

3、CL2)，共1591p，與毛果楊、丹參等的的4CL基因有75％以上的相似性。
　　(3)利用RT-PCR及Northern雜交方法分析CCoA OM及4CL1在不同時期既不同部位表達(dá)特征。結(jié)果表明CCoAOM基因在7月中旬表達(dá)最強，從8月開始逐漸減弱，到9月則已經(jīng)終止;4CL1基因在白樺木質(zhì)部中表達(dá)含量最高，其次為葉片、雌花、雄花。
　　(4)應(yīng)用生物信息學(xué)方法分別對已知的4CL1與CCoAOMT序列進行分析，分別分析這兩個