慈竹木質(zhì)素合成酶基因CCoAOMT、COMT和CAD的克隆、生物信息學(xué)分析與組織表達(dá)分析.pdf

1、01assIfledndexSouthwestUnversityofSoienceandTechnoIogyMasterDegreeThesisCIoningBi0informatjonAnaIysiSandTissueExpressionofCCoAOMTCOMTandCADGenefromNeosinocalamus日f#inisGrade：2009Candidate：XiaoyuWuAcademicDegreeAppIedorMa

2、steoSpeeaIity：BotanySupervisorShangIanHu西南科技大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文第1頁摘要竹漿造紙中竹木質(zhì)素的脫除，不但污染環(huán)境，而且提高了造紙成本，因此，用基因工程手段培育新型竹材己成為當(dāng)今國內(nèi)外的研究熱點(diǎn)。目前，在己知竹漿用竹種中，只從綠竹和毛竹中克隆得到木質(zhì)素合成酶基因CCoAO#TCOHT和CAD，而慈竹中未見報(bào)道。為此，本研究以纖維質(zhì)量好的慈竹為研究材料，采用RACE技術(shù)克隆和同源克隆CCoAOM

3、TCOMT和d口基因，并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)和組織表達(dá)分析，為CCoAOMTCOMT和酬口基因在大型叢生竹遺傳改良中的應(yīng)用提供理論依據(jù)。主要研究結(jié)果如下：i采用Race技術(shù)克隆井獲得了一個(gè)慈竹木質(zhì)素臺(tái)成酶CCoAOMT基因全長序列(GenBank注冊(cè)號(hào)為JF742462)，命名為％jCCoAOMTI：COYT基因全長序列(GenBank登錄號(hào)為iN837484)，命名為AjCOgT；CAD基因的保守區(qū)及其3’RACEeDNA。2生物信息學(xué)

4、分析結(jié)果表明，慈竹CCoAOMT基因eDNA全長序列，全長為i051bpt含有一個(gè)777bp的讀碼框，編碼個(gè)包含258個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)，分子量約為28861kD，等電點(diǎn)為533，二級(jí)結(jié)構(gòu)中Ⅱ螺旋占4225％，B一轉(zhuǎn)角占891％，延伸鏈占1589％、無規(guī)卷曲占3295％。氨基酸多序列比對(duì)結(jié)果表明，慈竹與綠竹的CCoAOMTI基因親緣關(guān)系最近，但慈竹CCoA刪瑾因編碼的氨基酸與綠竹相比，在第十位點(diǎn)上發(fā)生了缺失，5個(gè)位點(diǎn)發(fā)生了變異。慈竹、綠竹

5、、毛竹、玉米CCo40M瑾因編碼的氨基酸中部含有1個(gè)相對(duì)保守的無序化區(qū)域。慈竹COMT基因eDNA全長序列為1378bp，其編碼一個(gè)包含360氨基酸的蛋白，分子量約為389741kD，理論等電點(diǎn)為538。預(yù)測(cè)其氨基酸序列包含29個(gè)酸性殘基(AspGIu)，41個(gè)堿性殘基(ArgLys)，總親水性平均系數(shù)0079。其中176個(gè)氨基酸可能形成a一螺旋，32個(gè)氨基酸可能形成B轉(zhuǎn)角，49個(gè)氨基酸可能形成延伸鏈，103個(gè)氨基酸可能形成無規(guī)卷曲。多