桔小實蠅注射法RNAi效率提升方法的研究.pdf

1、雙鏈RNA（dsRNA）介導(dǎo)的RNA干擾（RNAi，RNA interference）技術(shù)通過dsRNA誘導(dǎo)序列特異性轉(zhuǎn)錄后基因沉默，已成為昆蟲基因功能研究的重要手段，在害蟲防治領(lǐng)域亦具有潛在的應(yīng)用價值。一些研究表明，昆蟲通過胞吞作用吸收dsRNA，H2O2能提升細胞對 dsRNA的吸收；脂質(zhì)體保護dsRNA，克服與細胞膜之間的靜電斥力進入細胞；殼聚糖與dsRNA形成的納米顆?？梢杂行ПＷodsRNA，提升對dsRNA的轉(zhuǎn)運能力。同時，高

2、溫、低溫、大腸桿菌等誘導(dǎo)可引起RNAi通路相關(guān)基因諸如Dicer-2、Ago-2和R2D2等的表達上調(diào)，從而激活RNAi。目前，對桔小實蠅進行RNAi多采用注射法和飼喂法，而dsRNA介導(dǎo)的RNAi在雙翅目昆蟲普遍存在沉默效率不高、持效性差等問題。據(jù)此，本學(xué)位論文選取桔小實蠅3個不同類型的基因，包括組成性表達的肌動蛋白基因Actin-2、脂肪體和馬氏管特異性高表達的羧酸酯酶基因CarE-6以及在中樞神經(jīng)系統(tǒng)高表達的神經(jīng)肽基因Natali

3、sin，對桔小實蠅注射添加不同介質(zhì)的dsRNA以及桔小實蠅經(jīng)高低溫或E.coli誘導(dǎo)處理后注射dsRNA，采用RT-qPCR技術(shù)檢測3個基因的RNAi效率，通過分析獲得提高不同類型基因RNAi效率的技術(shù)方案，為基于注射法的RNAi技術(shù)研究桔小實蠅基因的功能提供技術(shù)基礎(chǔ)。主要結(jié)果如下：
　　1、三種介質(zhì)對桔小實蠅RNAi效率的時間效應(yīng)
　　在1.5μg4000 ng/μL的dsRNA中分別添加H2O2（100 nL，質(zhì)量分數(shù)5

4、％）、Lipofectamine RNAimax（dsRNA與其質(zhì)量體積比4:1）和Chitosan（質(zhì)量體積比濃度0.02%）后對桔小實蠅進行混合注射，采用RT-qPCR技術(shù)檢測靶標基因在注射后12 h、24 h、48 h和72 h的RNAi效率。結(jié)果表明，添加3種介質(zhì)后，不同基因在不同檢測時間點的RNAi效率存在差異。其中，添加H2O2后，Actin-2在72 h的RNAi效率得到提升，CarE-6在48 h的RNAi效率得到提升，

5、Natalisin在12h、24h和48h的RNAi效率得到提升，但與單獨注射dsRNA相比較差異不顯著。添加Lipofectamine RNAimax后，Actin-2在48 h的RNAi效率提升，CarE-6在48 h和72 h的RNAi效率得到提升，Natalisin在48 h的RNAi效率得到顯著提升，在72 h的RNAi效率得到提升。添加Chitosan后，Actin-2在48 h和72 h的RNAi效率得到提升，CarE-6

6、在72 h的RNAi效率得到提升，Natalisin在48 h的RNAi效率得到顯著提升，在72 h的 RNAi效率提升。說明添加H2O2、Lipofectamine RNAimax或殼聚糖可以提升桔小實蠅RNAi的效率?；谝陨蠙z測結(jié)果，在后續(xù)條件優(yōu)化中，分別選取在注射dsActin72 h、dsCarE48 h和dsNatalisin24 h后進行各基因RNAi效率的分析。
　　注射不同劑量的dsRNA（0.5μg、1μg和1

7、.5μg）后，3個基因的RNAi效率呈現(xiàn)dsRNA劑量依賴性，劑量越大，RNAi效率越高。
　　2、三種介質(zhì)對桔小實蠅RNAi效率的劑量效應(yīng)
　　在1.5μg4000 ng/μL的dsRNA中分別添加不同劑量的H2O2、Lipofectamine RNAimax和Chitosan后對桔小實蠅進行混合注射，采用RT-qPCR技術(shù)檢測靶標基因的RNAi效率。結(jié)果表明，對桔小實蠅注射dsRNA+H2O2（100 nL，質(zhì)量分數(shù)5%

8、），3個基因的RNAi效率均有所提升，但差異不顯著；注射dsRNA+H2O2（100 nL，質(zhì)量分數(shù)10%和15%）后，RNAi效率均有所下降。說明注射在H2O2質(zhì)量分數(shù)為5%時可以提升對靶標基因的 RNAi效率，但不作為首選技術(shù)方案。對桔小實蠅注射dsRNA+Lipofectamine RNAimax（質(zhì)量體積比2:1）后，3個基因的RNAi效率均顯著提升，該方案可作為桔小實蠅基于注射法的RNAi優(yōu)選方案。對桔小實蠅注射dsRNA+C

9、hitosan后均能不同程度地提高對靶標基因的RNAi效率。其中，dsActin添加Chitosan（質(zhì)量體積比濃度為0.08%）能夠顯著提升RNAi效率，添加3個濃度的殼聚糖均能顯著提升對靶標基因CarE-6的 RNAi效率，當dsNatalisin添加Chitosan（質(zhì)量體積比濃度為0.02%、0.04%）時，能顯著提升對靶標基因Natalisin的RNAi效率?；赗NAi效率與成本考慮，對于組織特異性高表達的基因CarE-6和

10、Natalisin選擇添加質(zhì)量體積比濃度為0.02%的Chitosan，對于組成性表達的基因Actin-2選擇添加質(zhì)量體積比濃度為0.08%的Chitosan，以便獲得最佳的RNAi效果。
　　3、E.coli或高低溫處理對桔小實蠅RNAi效率的影響
　　對桔小實蠅注射不同體積的E. coli（OD600=1.0，100 nL、200 nL、400 nL）12 h后，注射1.5μg4000 ng/μL dsRNA，RT-qP

11、CR分析結(jié)果顯示，100 nL E.coli+dsActin、100 nL/200 nL E.coli+dsCarE以及200 nL E.coli+dsNatalisin處理后，對3個基因的RNAi效率無顯著提升。200 nL/400 nL E.coli+dsActin、400nL E.coli+dsCarE以及100 nL/400 nL E.coli+dsNatalisin處理后，RNAi效率均有所降低。因此， E.coli誘導(dǎo)桔小實

12、蠅不能有效提升對靶標基因的RNAi效率。
　　分別將桔小實蠅置于低溫12℃和高溫42℃處理30 min后注射dsRNA，27℃條件下注射dsRNA為對照。RT-qPCR結(jié)果顯示，與對照相比，高溫或低溫處理桔小實蠅會降低對靶標基因的RNAi效率。因此，在室溫27℃條件下進行基于注射法的RNAi，能夠獲得較好的RNAi效率。
　　綜上所述，針對不同類型的基因，為實現(xiàn)對靶標基因的有效干擾，明確基因功能，推薦如下RNAi方案：

13、>　?。?）組成性表達的基因，27℃下，1.5μg4000 ng/μL的dsRNA，混合注射dsRNA+Lipofectamine RNAimax（質(zhì)量體積比2：1），或混合注射dsRNA+Chitosan（質(zhì)量體積比濃度0.08%），注射后48 h-72 h檢測表型。
　?。?）脂肪體和馬氏管特異性表達的基因，27℃下，1.5μg4000 ng/μL的dsRNA，混合注射dsRNA+Lipofectamine RNAimax（質(zhì)