FGFR1、FGF10和FGF18基因多態(tài)性與非綜合征性唇腭裂相關(guān)研究.pdf

1、目的：探討FGFR1、FGF10和FGF18基因多態(tài)性與中國(guó)部分人群發(fā)生非綜合征性唇腭裂（Nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate，NSCL/P）的關(guān)系。 方法：實(shí)驗(yàn)選擇75個(gè)非綜合征性唇腭裂核心家庭（其中包括患兒及其生物學(xué)父母）和75個(gè)無(wú)唇腭裂畸形的正常兒童作為對(duì)照，收集其臨床資料和血液標(biāo)本，提取其外周血基因組DNA。FGFR1基因rs13317位點(diǎn)采用限制性片段長(zhǎng)

2、度多態(tài)性分析；FGFR1基因p．E467K、p．M369I、p．S393S，F(xiàn)GF10基因rs1448037和FGF18基因rs4043716位點(diǎn)采用三維丙烯酰胺凝膠基因芯片方法進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性的檢測(cè)。通過(guò)部分樣本重復(fù)檢測(cè)和測(cè)序驗(yàn)證的方法控制并保證結(jié)果的準(zhǔn)確性。根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果得出的基因型數(shù)據(jù)，比較患兒組與對(duì)照組的基因型和等位基因頻率；對(duì)全部核心家庭的數(shù)據(jù)進(jìn)行單倍型相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)分析（Haplotype relative risk，HRR）和以

3、家系為基礎(chǔ)的關(guān)聯(lián)檢驗(yàn)（Family based association test，F(xiàn)BAT）；對(duì)含雜合子父母的核心家庭進(jìn)行傳遞不平衡檢驗(yàn)（Transmitted disequillibrium test，TDT）。 結(jié)果：FGFR1基因：p．E467K、p．M3691和p．S393S三個(gè)位點(diǎn)在所有研究樣本中均未檢測(cè)出多態(tài)性，三個(gè)位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的堿基均為G，rs13317位點(diǎn)檢測(cè)出多態(tài)性。對(duì)rs13317基因型數(shù)據(jù)進(jìn)行分析：患兒組和對(duì)照

4、組基因型和等位基因頻數(shù)進(jìn)行病例對(duì)照研究發(fā)現(xiàn)分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P>0．05）；病例組核心家庭TDT檢驗(yàn)X2=0．056，P>0．05；HRR檢驗(yàn)X2=0．058，P=0．809；FBAT檢驗(yàn)Z=0．236，P>0．05。FGF10基因：rs1448037檢測(cè)出多態(tài)性，對(duì)其基因型分型結(jié)果進(jìn)行分析：患兒組和對(duì)照組基因型和等位基因頻數(shù)進(jìn)行病例對(duì)照研究發(fā)現(xiàn)分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P>0．05）；病例組核心家庭TDT檢驗(yàn)X2=0．529，P>0．

5、05；HRR檢驗(yàn)X2=0．506，P=0．477；FBAT檢驗(yàn)Z=0．728，P>0．05。FGF18基因：rs4043716檢測(cè)出多態(tài)性，對(duì)其基因型分型結(jié)果進(jìn)行分析：患兒組和對(duì)照組基因型和等位基因頻數(shù)進(jìn)行病例對(duì)照研究，發(fā)現(xiàn)基因型分布差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，P=0．045，進(jìn)一步分析得出基因型TTvs．CTX2=4．688 P=0．030 OR=0．386（0．161-0．925）。等位基因頻數(shù)的分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P>0．05）；病例組核

6、心家庭TDT檢驗(yàn)X2=0．012，P>0．05；HRR檢驗(yàn)X2=0．013，P=0．908；FBAT檢驗(yàn)Z=0．111，P>0．05。 結(jié)論：FGF18基因rs4043716位點(diǎn)多態(tài)性和中國(guó)人群NSCL/P可能存在一定的相關(guān)性；FGFR1基因rs13317和FGF10基因rs1448037位點(diǎn)多態(tài)性與中國(guó)部分人群NSCL/P可能無(wú)相關(guān)性；FGFR1基因p．E467K、p．M369I和p．S393S三個(gè)位點(diǎn)未檢出多態(tài)性，與中國(guó)部分