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1、非綜合征性唇腭裂(Non-syndromiccleftlipwithorwithoutcleftpalate,NSCL/P)是人類最常見的先天畸形之一,發(fā)病機(jī)制目前還不明確,學(xué)界普遍認(rèn)為NSCL/P是一種多基因復(fù)雜遺傳疾病,近年來(lái)的研究結(jié)果顯示許多基因和NSCL/P的發(fā)生有關(guān)。
近年來(lái)研究顯示母親孕期增補(bǔ)葉酸可以降低非綜合征性唇腭裂唇腭裂的發(fā)生,葉酸代謝相關(guān)基因成為目前非綜合征性唇腭裂研究的熱門候選基因,亞甲基四氫葉酸脫氫酶1
2、(Methylenetetrahydrofolate-dehyd-rogenase1,MTHFD1)在葉酸代謝過程中催化三個(gè)連續(xù)的反應(yīng),其基因多態(tài)性可能會(huì)導(dǎo)致NSCL/P的發(fā)生;蛋氨酸合成酶(methioninesynthase,MTR/MS)是蛋氨酸代謝循環(huán)中的一個(gè)關(guān)鍵酶,其活性下降可能會(huì)使血液中的高半胱氨酸水平升高,影響DNA的甲基化,誘發(fā)NSCL/P。
本次研究通過對(duì)山西人群135個(gè)NSCL/P核心家系和150例正常新生
3、兒及其母親MTHFD1基因rs2236225位點(diǎn)和MTR基因rs1805087位點(diǎn)多態(tài)性進(jìn)行檢測(cè),從人群關(guān)聯(lián)研究和核心家系分析兩方面探討這兩個(gè)位點(diǎn)多態(tài)性與NSCL/P的相關(guān)性。
目的:研究MTHFD1基因rs2236225位點(diǎn)和MTR基因rs1805087位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性與山西人群NSCL/P的相關(guān)性。
方法:收集135個(gè)非綜合征性唇腭裂核心家系外周靜脈血、150例正常新生兒臍帶組織及其母親外周靜脈血,提取所有標(biāo)本
4、DNA,采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR-RFLP)方法對(duì)所有標(biāo)本MTHFD1基因rs2236225位點(diǎn)和MTR基因rs1805087位點(diǎn)的多態(tài)性進(jìn)行檢測(cè);Pearsonχ2檢驗(yàn)人群基因型分布是否符合HWE(Hardy-WeinbergEquilibrium,哈迪-韋恩伯格平衡),用人群關(guān)聯(lián)研究,病例組核心家庭的傳遞不平衡檢驗(yàn)(transmissiondisequilibriumtest,TDT)和單體型的相對(duì)危險(xiǎn)度(h
5、aplotype-basedhaplotyperelativerisk,HHRR)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。
結(jié)果:MTHFD1基因rs2236225位點(diǎn):病例組與對(duì)照組相比較,子代和母親的基因型分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),但是子代等位基因頻率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);按唇腭裂類型分層后,唇裂組中子代基因型分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),基因型頻率比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。唇腭裂組中,子代的基因型分布及
6、等位基因頻率比較差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。傳遞不平衡檢驗(yàn)提示,rs2236225位點(diǎn)突變A等位基因在NSCL/P核心家庭中存在傳遞失衡(χ2=11.88,P<0.05);HHRR檢驗(yàn)χ2=16.48,P=0.00,OR=2.101,95%CI:1.465-3.014。
MTR基因rs1805087位點(diǎn):本研究中GG基因型較少,故將AG和GG基因型合并后與AA比較,子代及母親病例組和對(duì)照組之間基因型分布和等位基因頻率比
7、較差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);唇裂組和唇腭裂組子代及母親基因型分布和等位基因頻率與對(duì)照組差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);病例組核心家庭分析,TDT檢驗(yàn)χ2=0.083,P>0.05,HHRR分析χ2=0.112,P>0.05,說明攜帶有突變基因G并不能增加NSCL/P的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。
結(jié)論:本次研究發(fā)現(xiàn)MTHFD1基因rs2236225位點(diǎn)多態(tài)性與山西人群非綜合征性唇腭裂的發(fā)生存在關(guān)聯(lián);未顯示MTR基因rs180508
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