廣西寵物犬星狀病毒分子流行病學調(diào)查及ORF2基因序列分析.pdf

1、犬星狀病毒(Canine Astrovirus，CAstV)是引發(fā)犬胃腸炎疾病的病原之一。近年來，該病毒在患有腸道腹瀉犬中被確定，序列分析發(fā)現(xiàn)其屬于獨有的星狀病毒物種，但是該病原在寵物犬中的臨床表現(xiàn)形式及其流行規(guī)律，目前尚未清楚。因此，本研究旨在了解CAstV在寵物犬群中的臨床流行特征和基因型分布特點，為進一步治療該疾病和了解CAstV流行規(guī)律提供科學依據(jù)。
　　本研究主要收集2015年11月-2016年08月不同臨床特征、不同性

2、別、不同年齡寵物犬群的253份糞便樣品。利用RT-巢式PCR(RT-nPCR)方法對CAstV進行臨床流行病學調(diào)查。研究發(fā)現(xiàn)，患有腹瀉的犬只CAstV檢測陽性率高達25.3％，進一步證實腹瀉癥狀與CAstV感染的相關性。此外，對不同品種、性別和生長階段的寵物犬感染CAstVs進行分析調(diào)查，結果發(fā)現(xiàn)，不同品種和性別的寵物犬都能可以感染該病毒，其中幼年犬（≤6月齡）最為易感，感染率高達到18.6％。同時我們發(fā)現(xiàn)該病毒主要與犬細小病毒(CPV

3、)伴發(fā)感染，其感染率達23.4％。有趣的是，健康犬也可攜帶該病毒，陽性率為5.9％。這說明CAstV普遍存在于寵物犬中，甚至呈隱性感染。
　　本研究根據(jù)部分ORF1b基因構建了氨基酸遺傳進化樹，旨在進一步了解CAstV的基因型分布特點，首次在廣西犬群中發(fā)現(xiàn)CAstV可以分為哺乳動物5、3和2型，與它們的氨基酸同源性分別為84.6-100％、97.5-100％和94.9-100％。同時我們根據(jù)部分ORF2基因構建了遺傳進化樹，分析發(fā)

4、現(xiàn)，所獲得的13株病毒株同屬于哺乳動物5型CAstV譜系，但是被分成了兩個小分支，分別與中國和意大利毒株在一個分支上，與國內(nèi)報道有所不同。
　　此外，本研究成功擴增全長衣殼蛋白（ORF2基因），并根據(jù)對氨基酸序列進行系統(tǒng)分析和構建遺傳進化樹。結果表明ORF2基因全長為2325bp，編碼775個氨基酸。根據(jù)保守性劃分為三個區(qū)域中，以區(qū)域Ⅱ(447aa-730aa)變異較大，除了與2005年意大利毒株和英國毒株(Gillingham/