廣西HP-PRRSV分子流行病學(xué)研究.pdf

1、豬繁殖與呼吸綜合征作為一種高度接觸性傳染病，由豬繁殖與呼吸綜合征病毒(Porcinereproductiveandrespiratorysyndromevirus，PRRSV)引起。該病的主要特征是母豬繁殖障礙，仔豬呼吸道癥狀及斷奶仔豬高死亡率。其在世界范圍內(nèi)的流行，給世界各國(guó)的養(yǎng)豬業(yè)造成了沉重的打擊。特別是2006年我國(guó)南方省份暴發(fā)的PRRSV變異株引起的“豬高熱病”給我國(guó)的養(yǎng)豬業(yè)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。
　　 本研究對(duì)廣西200

2、8-2010年送檢的1689份樣品進(jìn)行檢測(cè)，陽(yáng)性樣品一共411份，陽(yáng)性率達(dá)到24.3％，其中變異株295株，陽(yáng)性率為17.5％；傳統(tǒng)株37株，陽(yáng)性率為2.2％；混合感染79株，陽(yáng)性率為4.7％。在PRRSV陽(yáng)性中，變異株所占比重為71.8％，傳統(tǒng)株所占比重為9％，混合感染所占比重為19.2％。篩選部分PRRSV陽(yáng)性樣品，進(jìn)行Nsp2基因全長(zhǎng)的擴(kuò)增及序列比對(duì)分析，總共獲得35個(gè)Nsp2全長(zhǎng)基因，其核苷酸同源性為89.7％-99.7％，與V

3、R-2332的同源性為80.5％-83.7％，與CH-1a的同源性為89.6％-92.3％，與JXA1的同源性為92％-99.3％；Nsp2基因間推導(dǎo)的氨基酸同源性為84.8％-99.7％，與VR-2332的同源性分別為74.5％-78％，與CH-1a的同源性分別為84.4％-88.4％，與JXA1的同源性分別為88.2％-99.1％。Nsp2基因推導(dǎo)的氨基酸位點(diǎn)變異分析表明，與美洲型代表毒株VR-2332相比，35個(gè)序列中，有32個(gè)N

4、sp2推導(dǎo)氨基酸序列在481位和533-561位共同發(fā)生了不連續(xù)的30個(gè)氨基酸缺失，其中GXNN03-2010在12-14位額外缺失了3個(gè)氨基酸，GXNN01-2009、GXNN02-2009在485-488位額外缺失4個(gè)氨基酸。另外，GXNN07-2009在468位缺失1個(gè)氨基酸。核苷酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明，本研究所得35個(gè)Nsp2基因主要分屬以HB-1為代表的亞群3和以JXA1為代表的亞群4。
　　 通過病毒分離，本研究獲

5、得GX59-2008、GX12-2009兩株HP-PRRSV，全基因組測(cè)序表明，GXNN59-2008基因組全長(zhǎng)為15332bp，GXNN12-2009基因組全長(zhǎng)為15325bp，2株間全基因組核苷酸序列的同源性為98％，與LV株的同源性分別為60.7％、60.6％，與VR-2332的同源性分別為89.5％、88.9％，與JXA1的同源性分別為98.9％、98.3％。通過全基因組主要氨基酸位點(diǎn)分析，本研究所得2個(gè)毒株均屬于野毒株。9個(gè)毒