用于豬肉產(chǎn)品溯源的相關(guān)SNP的挖掘與引物篩選.pdf

1、我國(guó)是生產(chǎn)和消費(fèi)豬肉量最大的國(guó)家，豬肉是我國(guó)居民消費(fèi)的最主要肉類產(chǎn)品，對(duì)其建立有效的溯源系統(tǒng)，更是迫在眉睫。隨著當(dāng)代高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，DNA標(biāo)記已經(jīng)逐漸被用于肉類產(chǎn)品的溯源系統(tǒng)建立。在DNA標(biāo)記中，SNP(Single Nucleotide Polymorphisms)標(biāo)記，以其相對(duì)簡(jiǎn)單且檢測(cè)成本較低，是一種可有效對(duì)豬肉產(chǎn)品進(jìn)行溯源的遺傳學(xué)方法。為種豬檔案庫(kù)建設(shè)所需，本研究選用我國(guó)最常用的商品豬種洛克、長(zhǎng)白和大約克豬，對(duì)杜洛克、長(zhǎng)白

2、和大約克豬個(gè)體身份的DNA識(shí)別進(jìn)行了研究。并提供了一種新的遺傳標(biāo)記——“多位點(diǎn)合并基因型DNA片段”，用于豬個(gè)體身份識(shí)別及其產(chǎn)品的溯源。
　　一、為了更多地挖掘可用于豬個(gè)體識(shí)別的SNP，共篩選了8對(duì)引物，PCR擴(kuò)增后將產(chǎn)物直接測(cè)序，得到了63個(gè)SNP。取雜合度≥0.10的SNP，這些SNP在不同品種中所組成的基因型數(shù)目不同，最終可用于實(shí)驗(yàn)中三個(gè)品種溯源的SNP，在杜洛克中有16個(gè)，在長(zhǎng)白中13有個(gè)，在大約克中有17個(gè)，可組成131

3、220（杜洛克）、2160（長(zhǎng)白）、6480（大約克）種基因型。以這些SNP為基礎(chǔ)的基因分型策略，足以應(yīng)用到飼養(yǎng)杜洛克豬的豬場(chǎng)進(jìn)行豬肉產(chǎn)品的個(gè)體識(shí)別或溯源。對(duì)于其他豬種，則需要獲得更多的SNP才能夠?qū)崿F(xiàn)。
　　二、為了檢測(cè)出足夠可用的SNP，提出了“多位點(diǎn)合并基因型DNA片段篩選”的方法，尋找可用于豬個(gè)體身份識(shí)別及其產(chǎn)品溯源的SNP?！岸辔稽c(diǎn)合并基因型DNA片段”較其他DNA標(biāo)記包含更多的SNP，產(chǎn)生更多不同的基因型，更有利于溯源