基因1b型慢性丙型肝炎患者抗病毒治療過程中氨基酸序列分析.pdf

1、目的：探討基因1b型慢性丙型肝炎患者氨基酸序列變異與聚乙二醇干擾素α(PEG-IFNα)2a聯合利巴韋林(RBV)抗病毒治療療效的關系。
　　方法：回顧性選擇18例應用PEG-IFNα2a/RBV抗病毒治療48周的基因1b型慢性丙型肝炎患者(9例為快速應答者，9例為無應答者)，應用RT-PCR法擴增接近全長的HCV基因組序列，用克隆測序方法進行核苷酸序列測定。通過在多聚蛋白和各個蛋白水平比對兩組序列氨基酸突變數目及去除T細胞表位后

2、的氨基酸突變數目，計算遺傳距離等方法以比較兩組序列的差別。
　　結果：抗病毒治療前序列分析未發(fā)現與治療應答相關的單個氨基酸變異，且系統(tǒng)進化分析未顯示與應答相關的變異簇集現象。進一步比對發(fā)現NS5B區(qū)尤其是拇指區(qū)域的部分氨基酸序列(aa371-458)及NS5A-V3區(qū)(aa384-407)序列變異與PEG-IFNα2a聯合RBV抗病毒應答情況密切相關(P值分別為0.002和0.029)。NS5B區(qū)氨基酸突變數目與V3區(qū)氨基酸突變數

3、目存在正相關(r=0.568，.P=0.027)。NR組患者抗病毒治療12周后的序列與基線序列相比，Core、NS3、NS4B和NS5B區(qū)域氨基酸突變數目較抗病毒治療前略有增加，而E1、E2、P7、NS2和NS4A的氨基酸突變數目在抗病毒治療12周后有所減少，但差別并無統(tǒng)計學意義，抗病毒治療后并未發(fā)現與應答相關的單個氨基酸突變。
　　結論：NS5B區(qū)尤其是拇指區(qū)域的部分氨基酸序列及V3區(qū)序列變異與干擾素療效密切相關，且NS5B區(qū)氨