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文檔簡介
1、[目的]分析粵西地區(qū)漢族人群Omi/Htra2基因啟動子-958C/G、內(nèi)含子5-59A/G、編碼區(qū)1195G/A單核苷酸多態(tài)性(SNPs)頻率分布特點,并探討其與帕金森病(PD)發(fā)病的關(guān)系。
[方法]采用病例-對照研究,選擇粵西地區(qū)漢族人群中56例PD病人(病例組)和109例健康體檢者(對照組)為對象,應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性酶切片段長度多態(tài)性分析方法(PCR-RFLP)檢測Omi/Htra2基因SNP-958C/G、5
2、-59A/G和1195G/A,并分析其基因型及等位基因頻率在正常人群及PD患者中的分布特點。
[結(jié)果]
1.Omi/Htra2基因SNP-958C/G在病例組中G等位基因頻率為25.0%,對照組為15.6%,差異有顯著性意義(P=0.038);病例組CC基因型為53.6%,對照組為69.7%,差異亦有顯著性意義(P=0.040)。
2.Omi/Htra2基因SNP5-59A/G在病例組中A等位基
3、因頻率(46.4%)高于對照組(36.7%),差異顯示有相關(guān)傾向(P=0.073);AA基因型頻率21.4%亦高于對照組的11.0%,差異顯示亦有相關(guān)傾向(P=0.072)。經(jīng)性別分層分析發(fā)現(xiàn),僅在男性中有顯著性差異,病例組A等位基因頻率為48.6%,對照組為34.6%,其差異有相關(guān)傾向(P=0.051);AA基因型頻率(25.7%)高于對照組(10.3%),差異有顯著性意義(P=0.041)。
3.在病例組中發(fā)現(xiàn)有1個O
4、mi/Htra2基因1195G/A雜合子,而在對照組中沒有發(fā)現(xiàn)。
4.經(jīng)Logistic回歸分析后,Omi/Htra2-958C/G多態(tài)性的CC基因型與PD的發(fā)病呈獨立相關(guān)性(P=0.031);5-59A/G多態(tài)性的從基因型與PD的發(fā)病呈獨立相關(guān)趨勢(P=0.053);在男性中,0mi/Htra25-59A/G多態(tài)性的從基因型亦與PD的發(fā)病呈獨立相關(guān)性(P=0.046)。
5.對Omi/Htra2-958C/
5、G和5-59A/G位點進行連鎖不平衡性(linkage disequilibrium,LD)和單倍體型分析,D'=0.066,r2=0.001。單倍體型GA在病例組中的頻率明顯高于對照組,差異有顯著性意義(P=8.60e-005)。
[結(jié)論]
1.Omi/Htra2基因啟動子SNP-958C/G的G等位基因是PD的危險因素;CC基因型對PD有保護作用。
2.Omi/Htra2基因內(nèi)含子SNP5-
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