中國境內白斑綜合征病毒（WSSV）分離株的序列差異分析.pdf

1、白斑綜合癥病毒(White Spot Syndrome Virus，WSSV)是造成養(yǎng)殖對蝦大規(guī)模死亡的主要病毒性病原。該病毒是一種大型雙鏈DNA病毒，隸屬于Nimaviridae科，迄今為止共有3個WSSV基因組全序列在Genbank上公布，分別為泰國株中國臺灣株和中國大陸株。比對這3株全序列發(fā)現(xiàn)WSSV基因組中主要的可變區(qū)位點的差異方式可分為：缺失，重復單元數(shù)量差異，單核苷酸插入或缺失，單核苷酸多態(tài)性。 本實驗中采集到中國境

2、內的13個WSSV地理分離株。設計出了針對每個可變區(qū)位點的特異性PCR引物，檢測了這些分離株在傾向缺失的可變區(qū)位點ORF23/24，ORF14/15和可能的轉座酶基因中的序列差異，ORF75,ORF94和ORF125中非同源重復區(qū)單向重復單元的數(shù)量差異以及重復單元中的SNP。結果顯示，中國境內各地的WSSV來源是多重的，傳播過程較復雜，通過人為活動傳播的可能性較大。各個可變區(qū)在進化上是各自獨立的。 WSSV的致病相關基因主要類型

3、有病毒囊膜蛋白基因，核衣殼蛋白基因，病毒復制過程的關鍵酶基因，細胞因子受體基因，潛伏相關基因，抑制宿主細胞凋亡機制的基因等，本實驗中檢測了8個致病相關基因在13個分離株中的序列差異，以及由此導致的蛋白氨基酸差異，結果顯示，存在于這8個致病相關基因中的差異共三種情況：單核苷酸多態(tài)性，單核苷酸變異，單核苷酸插入。此結果為進一步研究各分離株的毒力差異奠定了基礎。 在本實驗研究過程中，PCR為主要的技術手段，為防止PCR產物遺留污染，在