江蘇省HCV分子流行病學(xué)與種系地理學(xué)研究.pdf

1、丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus，HCV)是一種嚴(yán)重危害人類健康的重要病原體，它主要通過輸血、靜脈注射、母嬰垂直等方式感染致病，可引起慢性肝炎，肝硬化，甚至肝癌。HCV的基因組為單股正鏈RNA，長約9.6kb。根據(jù)其核苷酸序列的差異性，可將HCV分為6個(gè)主要的基因型，每個(gè)基因型又可分為多個(gè)亞型。HCV基因型的分布具有明顯的地域差異，1-3型呈全球性流行，4-6型呈地方性流行。我國主要有1、2、3和6型4種HCV流行基因型

2、，普通人群(GP)中主要流行1b亞型，其次為2a，靜脈吸毒人群(IDUs)中則主要流行3型和6型。
　　 江蘇省地處經(jīng)濟(jì)發(fā)達(dá)的長三角地區(qū)，“滬寧線”貫穿于境內(nèi)，與以上海為中心的東部沿海地區(qū)緊密相連，大量流動人口的頻繁往來會有助于病毒的傳播，尤其是高危人群的流動，可能會增加病毒跨區(qū)域傳播的風(fēng)險(xiǎn)。利用現(xiàn)代病毒起源與進(jìn)化分析方法，深入了解江蘇省HCV不同基因型的進(jìn)化與傳播路徑，對闡明江蘇省HCV的分子流行病學(xué)特征和傳播趨勢，針對性制定

3、防控策略具有重要的參考價(jià)值。鑒于此，我們搜集了江蘇地區(qū)2010年1月到2012年9月期間來自不同城市包含IDUs和GP的血漿樣本，進(jìn)行HCV抗體檢測，從617份HCV抗體陽性樣本中提取病毒核酸，以HCV RNA為模板，采用逆轉(zhuǎn)錄巢氏PCR擴(kuò)增C/E2和NS5B基因片段，測序后獲得210條C/E2序列和212條NS5B序列，分別進(jìn)行同源性分析，確定其基因型。其中270份(43.8％) HCV抗體陽性樣本擴(kuò)增分型成功，1a亞型4例(1.5％

4、)，1b亞型142例(52.6％)，2a亞型26例(9.6％)，3a亞型18例(6.7％)，3b亞型34例(12.6％)，6a亞型30例(11.1％)，6n亞型11例(4.1％)，6u亞型1例(0.4％)，雙感染3例(1.1％)，重組1例(0.4％)。對江蘇省IDUs和GP中HCV亞型分布的比較發(fā)現(xiàn)，IDUs中3型和6型的流行比率(72.3％)顯著高于1型和2型(26.4％，P=0.000)，而GP中1型和2型的流行比率(87.5％)顯

5、著高于3型和6型(11.4％，P=0.000)。對江蘇省HCV各亞型地理分布的比較發(fā)現(xiàn)，蘇南地區(qū)（包括南京、鎮(zhèn)江、常州、無錫、蘇州）亞型的分布復(fù)雜多樣，至少存在9種流行亞型(1a，1b，2a，3a，3b，6a，6e，6n，6u)，而蘇北地區(qū)（包括泰州和南通）亞型的布相對單調(diào)，主要以1b，2a為主，還包括少量的3b和6a。
　　 采用BEAST種系地理學(xué)研究方法構(gòu)建的最大分枝可信(MCC)樹，表明1b的傳播路徑最為復(fù)雜多樣，不僅存

6、在從蘇南地區(qū)到蘇北地區(qū)的傳播方向，還有從蘇北地區(qū)傳入蘇南地區(qū)的方向以及蘇北地區(qū)之間的傳播方向。2a與3b有三條共同的傳播路徑，即從蘇州分別傳入南京，泰州和南通，且3b還存在從蘇州到其他蘇南城市的傳播路徑和從蘇北地區(qū)傳入蘇南地區(qū)的路徑。3a和6a的傳播主要在蘇南地區(qū)，且6a的傳播僅起源于蘇州，而3a還存在鎮(zhèn)江地區(qū)的起源傳播。江蘇省主要流行亞型存在從蘇南地區(qū)向蘇北地區(qū)傳播的趨勢，而且它們在江蘇地區(qū)有共同的傳播起源地（蘇州）。另外，系統(tǒng)進(jìn)化分