膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中離子通道的預(yù)后價(jià)值及KCNB1影響自噬的研究.pdf

1、第一部分基于RNA測(cè)序數(shù)據(jù)的3個(gè)離子通道基因組成的危險(xiǎn)評(píng)分在原發(fā)性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的預(yù)后價(jià)值
　　背景:
　　近年來(lái)研究表明，離子通道基因在膠質(zhì)瘤的進(jìn)展中起著重要作用。本研究目的在于應(yīng)用RNA測(cè)序數(shù)據(jù)篩選出能夠預(yù)測(cè)原發(fā)性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(pGBM)預(yù)后的基于離子通道基因的危險(xiǎn)評(píng)分。
　　方法:
　　通過單變量COX及t檢驗(yàn)在中國(guó)腦膠質(zhì)瘤大樣本庫(kù)(CGGA)各個(gè)級(jí)別的膠質(zhì)瘤中鑒定出3個(gè)與預(yù)后和級(jí)別相關(guān)的離子通道基因，并基于

2、這3個(gè)基因構(gòu)建危險(xiǎn)評(píng)分，賦予每個(gè)pGBM患者一個(gè)評(píng)分。根據(jù)評(píng)分中位值，將83例pGBM患者分成高危險(xiǎn)評(píng)分組(n=42)和低危險(xiǎn)評(píng)分組(n=41)。并利用基因功能分析(GO，Gene ontology)及基因富集分析(GSEA，Gene Set EnrichmentAnalysis)進(jìn)一步研究危險(xiǎn)評(píng)分相關(guān)的生物學(xué)功能。這些結(jié)果均在另外兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行驗(yàn)證(TCGA和REMBRANDT)。
　　結(jié)果:
　　我們篩選出3個(gè)與膠質(zhì)瘤

3、預(yù)后及級(jí)別相關(guān)的離子通道基因（KCNN4、KCNB1和KCNJ10），并且構(gòu)建了基于這3個(gè)基因表達(dá)值的危險(xiǎn)評(píng)分。生存分析發(fā)現(xiàn)相比較低危險(xiǎn)評(píng)分組，高危險(xiǎn)評(píng)分組患者預(yù)后要差，對(duì)化療反應(yīng)敏感，且COX多元回歸分析證實(shí)此危險(xiǎn)評(píng)分是一個(gè)獨(dú)立的預(yù)后預(yù)測(cè)因子。亞型分析顯示高危險(xiǎn)評(píng)分組傾向于膠質(zhì)瘤Mesenchymal型和IDH1野生型。GO分析顯示高危險(xiǎn)評(píng)分組傾向于凋亡和血管生成等功能。GSEA分析發(fā)現(xiàn)高危險(xiǎn)評(píng)分組傾向于細(xì)胞增殖和運(yùn)動(dòng)行為等功能。以上

4、結(jié)果均在另外兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中得到驗(yàn)證(TCGA和REMBRANDT)。
　　結(jié)論:
　　這個(gè)危險(xiǎn)評(píng)分系統(tǒng)能更好的預(yù)測(cè)pGBM患者的預(yù)后，并有助于膠質(zhì)瘤患者的個(gè)體化治療。
　　第二部分電壓門控性鉀離子通道KCNB1對(duì)膠質(zhì)瘤預(yù)后的影響及自噬機(jī)制研究
　　背景:
　　第一部分研究發(fā)現(xiàn)KCNB1與膠質(zhì)瘤級(jí)別及預(yù)后相關(guān)，本課題進(jìn)一步研究KCNB1影響膠質(zhì)瘤進(jìn)展的分子機(jī)制。
　　方法:
　　本研究收集42例膠質(zhì)

5、瘤獨(dú)立標(biāo)本進(jìn)行qRT-PCR驗(yàn)證，并收集41例Ⅲ級(jí)，83例Ⅳ級(jí)膠質(zhì)瘤標(biāo)本進(jìn)行Kaplan-Meier生存分析。整合系統(tǒng)生物學(xué)預(yù)測(cè)KCNB1的功能，然后采用免疫印跡、免疫熒光、流式細(xì)胞術(shù)、MTT等技術(shù)，通過體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)去驗(yàn)證。
　　結(jié)果:
　　qRT-PCR驗(yàn)證KCNB1表達(dá)與級(jí)別呈負(fù)相關(guān)，且生存分析表明KCNB1高表達(dá)組有較好的總生存期及無(wú)瘤生存期。生物學(xué)分析及實(shí)驗(yàn)證實(shí)KCNB1具有促進(jìn)自噬、凋亡，抑制增殖、侵襲功能。KCNB