24520.一種新型漢坦病毒的遺傳進化和流行病學研究

1、中國科學院武漢病毒研究所論文原創(chuàng)性聲明和使用授權說明原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明：呈交的學位論文，是本人在導師的指導下，獨立進行研究工作所取得的成果。除文中已經(jīng)注明引用的內(nèi)容外，本論文不含任何其他個人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的作品或成果。對本文的研究做出重要貢獻的個人和集體，均已在文中以明確方式標明。本聲明的法律責任由本人承擔。學位論文使用授權說明本人完全了解中國科學院武漢病毒研究關于收集、保存、使用學位論文的規(guī)定，即：按照中國科學院武漢病毒研

2、究要求提交學位論文的印刷本和電子版本，并提供目錄檢索和閱覽服務；武漢病毒研究所可以采用影印、縮印、數(shù)字化或其它復制手段保存論文；在不以贏利的前提下，武漢病毒研究所可以公布論文的全部或部分內(nèi)容。(保密論文在解密后應遵守此規(guī)定)論文作者簽名荔陟師簽名：日期：沙廠c，年，陰／El中國科學院研究生院博士學位論文：一種新型漢坦病毒的遺傳進化和流行病學研究摘要漢坦病毒屬于布尼亞病毒科(Bunyaviridae)漢坦病毒屬(Hantavirus，HV

3、)。HV是一種負性、單鏈、分節(jié)段、有包膜的RNA病毒，基因組由小(S)、中(M)和大(L)3個片段組成，分別編碼核衣殼蛋白(N蛋白)、包膜糖蛋白(G蛋白)和病毒RNA依賴的RNA聚合酶(RdRp蛋白)。在中國大陸，證實主要存在漢灘病毒(HTNV)、漢城病毒(SEOV)、類Amur病毒、Puumala病毒、Khabarovsk病毒和Vladivostok病毒等HV。2009年我們在云南省瀘西縣大絨鼠(Eothenomysmiletus)體

4、內(nèi)發(fā)現(xiàn)一種新型HV，命名為瀘西漢坦病毒(Luxihantavirus，LUXV)。同時，對云南省一起實驗室大白鼠相關的Hv(其中一株命名為KY)爆發(fā)進行了調(diào)查研究。本研究主要對LUXV和KY進行了遺傳進化和流行病學等方面的研究，主要結果如下：2009年秋季在云南省瀘西縣共捕獲7屬12種217只小型哺乳動物，其中居民區(qū)105只，優(yōu)勢鼠種為黃胸鼠(Rattusflavipectus)：野外山地l12只，優(yōu)勢種為大絨鼠。用直接免疫熒光法(FA

5、)檢測動物肺臟組織中HV抗原，居民區(qū)HV總的感染率為380％(4／105)，陽性鼠為大足鼠(Rattusnitidus)、小家鼠(Musmusculus)和黃胸鼠；野外山地只在大絨鼠中檢測出Hv感染，感染率為1282％(10／78)。2010年春季共捕獲6屬8種113只小型哺乳動物，其中居民區(qū)30只，優(yōu)勢鼠種為黃胸鼠；野外山地83只，優(yōu)勢種為大絨鼠。居民區(qū)只在黃胸鼠中檢測出HV感染，感染率為3570％(1／28)。野外山地只在大絨鼠中檢

6、測出HV感染，感染率為2549％(13／51)。LUXV的S、M和L片段核苷酸序列全長度分別為2107bp、3663bp和6538bp，分別編碼HV的N蛋白為438aa，G蛋白為1139aa和I殂I郇蛋白為2154aa。從氨基酸水平上看，該病毒S片段與其它HV比較，同源性從449—792％最接近圖拉病毒(TULV，Ma322／2003株)、IslaVista病毒(ISLV，MCSB1株)和小河病毒(BAYV，Bayou株)，同源性分別為