單基因遺傳病的致病基因定位及候選基因分析.pdf

1、一、一個新的遺傳性牙齦纖維瘤致病基因座的定位分析。本課題對一個中國漢族五代遺傳性牙齦纖維瘤家系進(jìn)行初步連鎖分析，將該家系致病基因座定位在2號染色體短臂。對候選基因SOS1的突變分析在所有外顯子、外顯子/內(nèi)含子交界處以及側(cè)翼調(diào)控序列均未發(fā)現(xiàn)致病突變。隨后的局部基因組精細(xì)掃描以及單體型分析結(jié)果顯示，將該致病基因座位于D2S2221(端粒方向)和D2S1788(著絲粒方向)兩個STS標(biāo)記之間約11.4cM的區(qū)域內(nèi)。其中兩點與三點連鎖分析均在D

2、2S390處獲得了最大值，分別為3.45(θ=0)與5.0(4.38)。這表明，新發(fā)現(xiàn)的HGF基因座已經(jīng)與GINGF基因座不重疊，SOS1基因被完全排除在了新基因座之外。該基因座已經(jīng)被HUGO命名委員會命名為GINGF3。最近的研究顯示，在11p15上還存在一個新的受母源印跡影響的HGF位點，該位點的致病基因尚未被克隆。 二、非綜合征型軸后多指(趾)的候選基因篩選。手(足)畸形是新生兒中最常見的先天畸形之一。引起的肢端畸形的遺傳

3、因素通?？煞譃槿?，包括單基因病、多基因病和染色體畸變，相對來說，單基因突變引起的手(足)畸形更為常見。軸后多指(趾)(postaxial polydactyly,PAP；MIM174200)是一種較常見的肢端異常畸形，在已經(jīng)報道的非綜合征型遺傳性軸后多指(趾)病例中，7號、13號和19號染色體的基因突變都會引起軸后多指(趾)。另外，一些綜合征中，典型的軸后多指(趾)也會作為典型癥狀出現(xiàn)。軸后多指(趾)存在兩種表型，一種為A型，多余的指

4、(趾)有骨結(jié)構(gòu)并且發(fā)育良好；另一種是B型，多余的指(趾)沒有完全發(fā)育甚至可以只是皮膚上的一個肉贅。1997年，Radhakrishna等人將PAPA表型定位在7p15-q11.23。隨后，他們在GL13基因的第764號密碼子上發(fā)現(xiàn)了一個突變，從而確定GL13基因為PAP的致病基因。同年，Akarsu等人將另一個PAPA2位點定位在13q21-32。2002年，本室趙紅珊等人將PAPA3的位點定位在了19p13.2-13.1。2003年，

5、Galjaard等人在7號染色體上發(fā)現(xiàn)了另外一個新的PAP致病位點，該位點被定位在7q22。 在PAPA3位點的2.68 Mb范圍內(nèi)，一共有95個已知基因，其中功能已知基因64個，功能未知基因31個。本課題利用PCR-測序的方法，一共篩查了21個基因，其中16個基因完成了所有外顯子和外顯子-內(nèi)含子接頭部分的測序，剩余的5個基因均有少量外顯子還未完成。所有已經(jīng)完成測序的外顯子或者基因中均沒有發(fā)現(xiàn)致病突變。在實驗過程中我們發(fā)現(xiàn)三個d

6、bSNP未報道的堿基改變：一個是EMR2基因11外顯子的35位C>T改變，此堿基改變在蛋白水平會改變氨基酸，密碼子由GCC變成GTC，氨基酸由丙氨酸變成纈氨酸；另一個是EMR2基因12內(nèi)含子-9位的G>A改變；還有一個是RFX1基因內(nèi)含子5的3’端22bp重復(fù)。通過家系共傳遞分析和群體等位基因頻率統(tǒng)計，我們認(rèn)為這兩三位點的改變屬于多態(tài)而非致病突變。由于本課題至今尚未找到PAPA3位點的致病突變，我們將會從更多的方面去尋找更多的線索，選擇