FGFR1、FGF10和FGF18基因多態(tài)性與非綜合征性唇腭裂相關(guān)研究.pdf

1、目的：探討FGFR1、FGF10和FGF18基因多態(tài)性與中國部分人群發(fā)生非綜合征性唇腭裂（Nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate，NSCL/P）的關(guān)系。 方法：實驗選擇75個非綜合征性唇腭裂核心家庭（其中包括患兒及其生物學(xué)父母）和75個無唇腭裂畸形的正常兒童作為對照，收集其臨床資料和血液標(biāo)本，提取其外周血基因組DNA。FGFR1基因rs13317位點采用限制性片段長

2、度多態(tài)性分析；FGFR1基因p．E467K、p．M369I、p．S393S，F(xiàn)GF10基因rs1448037和FGF18基因rs4043716位點采用三維丙烯酰胺凝膠基因芯片方法進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性的檢測。通過部分樣本重復(fù)檢測和測序驗證的方法控制并保證結(jié)果的準(zhǔn)確性。根據(jù)實驗結(jié)果得出的基因型數(shù)據(jù)，比較患兒組與對照組的基因型和等位基因頻率；對全部核心家庭的數(shù)據(jù)進(jìn)行單倍型相對風(fēng)險分析（Haplotype relative risk，HRR）和以

3、家系為基礎(chǔ)的關(guān)聯(lián)檢驗（Family based association test，F(xiàn)BAT）；對含雜合子父母的核心家庭進(jìn)行傳遞不平衡檢驗（Transmitted disequillibrium test，TDT）。 結(jié)果：FGFR1基因：p．E467K、p．M3691和p．S393S三個位點在所有研究樣本中均未檢測出多態(tài)性，三個位點對應(yīng)的堿基均為G，rs13317位點檢測出多態(tài)性。對rs13317基因型數(shù)據(jù)進(jìn)行分析：患兒組和對照

4、組基因型和等位基因頻數(shù)進(jìn)行病例對照研究發(fā)現(xiàn)分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義（P>0．05）；病例組核心家庭TDT檢驗X2=0．056，P>0．05；HRR檢驗X2=0．058，P=0．809；FBAT檢驗Z=0．236，P>0．05。FGF10基因：rs1448037檢測出多態(tài)性，對其基因型分型結(jié)果進(jìn)行分析：患兒組和對照組基因型和等位基因頻數(shù)進(jìn)行病例對照研究發(fā)現(xiàn)分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義（P>0．05）；病例組核心家庭TDT檢驗X2=0．529，P>0．

5、05；HRR檢驗X2=0．506，P=0．477；FBAT檢驗Z=0．728，P>0．05。FGF18基因：rs4043716檢測出多態(tài)性，對其基因型分型結(jié)果進(jìn)行分析：患兒組和對照組基因型和等位基因頻數(shù)進(jìn)行病例對照研究，發(fā)現(xiàn)基因型分布差別有統(tǒng)計學(xué)意義，P=0．045，進(jìn)一步分析得出基因型TTvs．CTX2=4．688 P=0．030 OR=0．386（0．161-0．925）。等位基因頻數(shù)的分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義（P>0．05）；病例組核

6、心家庭TDT檢驗X2=0．012，P>0．05；HRR檢驗X2=0．013，P=0．908；FBAT檢驗Z=0．111，P>0．05。 結(jié)論：FGF18基因rs4043716位點多態(tài)性和中國人群NSCL/P可能存在一定的相關(guān)性；FGFR1基因rs13317和FGF10基因rs1448037位點多態(tài)性與中國部分人群NSCL/P可能無相關(guān)性；FGFR1基因p．E467K、p．M369I和p．S393S三個位點未檢出多態(tài)性，與中國部分