氫鍵系統(tǒng)中質(zhì)子傳遞和蛋白質(zhì)中能量傳遞的計(jì)算機(jī)模擬.pdf

1、本論文包括氫鍵系統(tǒng)中質(zhì)子傳遞的計(jì)算機(jī)模擬和蛋白質(zhì)中生物能量傳遞的計(jì)算機(jī)模擬。我們首先以龐小峰教授提出的氫鍵系統(tǒng)質(zhì)子傳遞新理論為基礎(chǔ),用四階Runge-Kutta方法和Matlab語(yǔ)言數(shù)值模擬了在受到雜質(zhì)、恒定外場(chǎng)、溫度和阻尼等因素影響下在這個(gè)系統(tǒng)中的質(zhì)子傳遞。模擬結(jié)果表明雜質(zhì)、恒定外場(chǎng)和阻尼系數(shù)能夠改變質(zhì)子的傳遞速度,但質(zhì)子仍能夠穩(wěn)定傳遞。溫度對(duì)質(zhì)子傳遞的影響較大,在190K左右質(zhì)子傳遞速度達(dá)到一個(gè)最大值,在210K左右達(dá)到一個(gè)最小值,

2、這與實(shí)驗(yàn)測(cè)出的結(jié)果完全符合。因此,我們的模擬結(jié)果證明龐小峰教授提出的新理論是完全正確的。然后我們以龐小峰教授在蛋白質(zhì)分子中提出的改進(jìn)的生物能量傳遞模型為基礎(chǔ),利用用四階Runge-Kutta方法和Matlab語(yǔ)言數(shù)值模擬了只含有一個(gè)量子的波函數(shù)和耦合系數(shù)χ2=0兩種特殊情況下單通道和三通道蛋白質(zhì)分子中的能量傳遞隨溫度的變化。在模擬過(guò)程中,我們綜合考慮了結(jié)構(gòu)無(wú)序性、溫度、雜質(zhì)及綜合因素下的生物能量傳遞的情況。模擬結(jié)果表明,在這兩種特殊情況