計算機輔助研究核苷類藥物與蛋白質(zhì)的相互作用.pdf

1、在人體血漿中，血清白蛋白的濃度為42gL-1，占蛋白總量的60％并提供80％的血液滲透壓。由于人血清白蛋白(HSA)具有在體內(nèi)儲存、運輸多種內(nèi)源和外源性化合物的功能，因此在生命過程中起著極其重要的作用。核苷類藥物可以直接抑制病毒的復(fù)制，有較強的抗病毒能力，在抗艾滋病毒、乙肝病毒等方面占有重要的地位。研究核苷類藥物與HSA相互作用的機理，對于揭示人體內(nèi)藥代動力學(xué)問題以及新的抗病毒藥物開發(fā)等方面有著重要的意義。熒光光譜是研究具有生物活性的藥

2、物小分子與生物大分子之間相互作用最常用的技術(shù)手段。基于先前的研究，在本文中利用熒光光譜法結(jié)合分子模擬技術(shù)，探討了在模擬人體生理條件下(pH=7.4，離子強度為0.1molL-l)阿糖尿苷、阿糖胞苷、2'-脫氧胞苷以及5’-腺苷單磷酸鈉四種核苷類藥物與HSA之間的相互作用。研究論文共分為五個部分:
　　 第一部分:緒論
　　 主要介紹了HSA在生命過程中的重要作用及它的結(jié)構(gòu)、生理功能，核苷類藥物概況，實驗中用到的技術(shù)手段和

3、本研究的當(dāng)前進展。
　　 第二部分:阿糖尿苷與HSA相互作用的研究
　　 利用熒光光譜法結(jié)合分子模擬研究了核苷類藥物阿糖尿苷與HSA的相互作用。根據(jù)光譜所得結(jié)果，作用的猝滅機理為靜態(tài)猝滅，分子間作用力主要為疏水作用力并計算得出了結(jié)合位點數(shù)。通過同步熒光光譜和三維熒光光譜，討論了在阿糖尿苷影響下HSA的構(gòu)象變化.
　　 第三部分:阿糖胞苷與HSA相互作用的研究
　　 阿糖胞苷與HSA之間的結(jié)合情況通過熒光光

4、譜和分子模擬技術(shù)研究得出:HSA的熒光光譜被阿糖胞苷明顯猝滅，計算得出熱力學(xué)參數(shù)(△G,△H和△S),結(jié)果表明阿糖胞苷與HSA之間主要通過疏水作用力發(fā)生顯著作用。根據(jù)同步和三維熒光光譜探討了HSA在反應(yīng)前后的構(gòu)象變化。
　　 第四部分:2’-脫氧胞苷與HSA相互作用的研究
　　 多種光譜方法和分子模擬方法被用于研究2’-脫氧胞苷與HSA之間相互作用。通過熒光光譜得出結(jié)論，2’-脫氧胞苷與HSA的結(jié)合機理是靜態(tài)猝滅過程，在

5、不同溫度下(284K,297Kand310K)計算得出了反應(yīng)的猝滅常數(shù)、結(jié)合常數(shù)以及結(jié)合位點數(shù)，2’-脫氧胞苷與HSA之間的作用主要通過疏水作用力產(chǎn)生。同時，討論了由于2’-脫氧胞苷的引入導(dǎo)致HSA發(fā)生了構(gòu)象變化。
　　 第五部分:5’-腺苷單磷酸鈉與HSA相互作用的研究
　　 在模擬生理條件下，通過熒光光譜技術(shù)結(jié)合分子模擬方法研究了5’-腺苷單磷酸鈉與HSA之間的結(jié)合作用。根據(jù)Stem-Volmer方程，靜態(tài)猝滅為反應(yīng)