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1、 本文針對兩個(gè)物種的不同的蛋白質(zhì)相互作用研究現(xiàn)狀相應(yīng)采用了兩種不同方法。模式生物酵母已經(jīng)存在大量蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù),而且這些數(shù)據(jù)主要集中于已知蛋白質(zhì)。我們將未知蛋白質(zhì)的用支持向量機(jī)預(yù)測的相互作用數(shù)據(jù)結(jié)合現(xiàn)有實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)預(yù)測未知蛋白質(zhì)功能。SVM方法預(yù)測的初始數(shù)據(jù)在通過已知蛋白質(zhì)的大量實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)建立的可靠蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)中得到篩選。加入SVM數(shù)據(jù)到測試數(shù)據(jù)后,功能預(yù)測的準(zhǔn)確率明顯提高。相對地,瘧原蟲缺少足夠的建立蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)
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