用半套式pcr檢測蜱和嚙齒動物中查菲埃立克體_第1頁
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1、<p>  用半套式PCR檢測蜱和嚙齒動物中查菲埃立克體</p><p>  關(guān)鍵字: 嚙齒動物 </p><p>  查菲埃立克體是1987年報道的人單核細(xì)胞埃立克體病的病原體[1],于1991年在美國被分離鑒定和定名[2]。該病臨床表現(xiàn)主要為發(fā)熱、頭痛、肌痛,實(shí)驗(yàn)室檢查有白細(xì)胞減少、血小板減少和轉(zhuǎn)氨酶升高。現(xiàn)已證明美洲花蜱(Amblyomma americanum)和變異

2、革蜱(Dermacentor variabilis)可以作為查菲埃立克體的傳播媒介,白尾鹿(Odocoileus virginianus)可能是其動物宿主[3]。目前報道的病例主要分布于美國南部,在歐洲、非洲亦有病人出現(xiàn),我國尚無該病例的報道,但南方很多地區(qū)的自然環(huán)境、氣候條件及蜱種均與美國該病流行區(qū)極為相似,在云南和福建的蜱中檢測到查菲埃立克體DNA特異片段[4]。為了解這些地區(qū)是否有查菲埃立克體自然疫源地的存在,及蜱類和野生動物的感

3、染情況,我們應(yīng)用半套式PCR技術(shù),檢測蜱及野生動物中查菲埃立克體DNA,對特異片段克隆后,進(jìn)行序列分析,現(xiàn)將結(jié)果報告如下: </p><p><b>  1 材料和方法 </b></p><p>  1.1 現(xiàn)場情況 調(diào)查點(diǎn)位于閩西北武夷山南麓山地,海拔300~700m,年平均溫度為17.6℃,相對濕度80%左右,年降雨量1600mm,植被以針、闊混交林為主,山多林深

4、,氣候濕潤,是動物繁殖和昆蟲孳生的適宜場所,存在多種自然疫源性疾病。 </p><p>  1.2 標(biāo)本的收集 蜱標(biāo)本系1997~1998年間從林區(qū)草叢采集的游離蜱及從家畜和野生動物宿主(山麂、山羊、野豬、野兔、狗、牛、狐貍等)體表捉到的寄生蜱,共計755只,經(jīng)鑒定,按種類和宿主分組檢測。野鼠和野兔系同期在該地捕獲,現(xiàn)場解剖,取脾和血塊冷藏保存,脾臟39份,血塊35份。野生動物種類及數(shù)量見表1。 </p&g

5、t;<p>  1.3 PCR引物 參照文獻(xiàn)[5、6] 構(gòu)建查菲埃立克體16S rRNA基因特異引物,外引物HE1和PER2可擴(kuò)增587bp的片段,HE1和HE3進(jìn)行半套式PCR可擴(kuò)增390bp的片段,引物的序列如下(根據(jù)M73222): </p><p>  HE1(49-77)5?-CAATTGCTTATAACCTTTTGGTTATAAAT-3? </p><p>  H

6、E3(438-412)5?-TATAGGTACCGTCATTATCTTCCCTAT-3? </p><p>  PER2(635-613)5?-CTCTACACTAGGAATTCCGCTAT-3? </p><p>  引物由軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院生物工程研究所合成。 </p><p>  1.4 PCR模板的制備 </p><p>  1.4.1 

7、蜱標(biāo)本 將蜱用75%的酒精浸泡30min后,用無菌生理鹽水洗3次,吸血蜱1只1組,未吸血蜱2只或5只1組,用研磨器研碎,加入含蛋白酶K 100μg/ml的TE 300μl,55℃水浴1h,用酚:氯仿法抽提,兩倍體積無水乙醇沉淀,70%酒精洗滌,干燥后,加50μlTE溶解,-20℃貯存?zhèn)溆谩?</p><p>  1.4.2 野鼠臟器及血塊標(biāo)本 以無菌操作取野鼠脾臟3mm見方小塊,用研磨器研碎(凍融的血取100μl

8、),加蛋白酶K消化液(0.1m M Tris-Cl pH8.0,0.5μm EDTA pH8.0,0.5% SDS,100μg/ml蛋白酶K)300μl,55℃水浴3h,中間多次振蕩,至清亮無可見組織塊,抽提及以后步驟同蜱標(biāo)本處理。 </p><p>  1.5 PCR擴(kuò)增 第一輪擴(kuò)增,取上述DNA模板3μl,10×PCR緩沖液3μl,引物(HE1和PER2)濃度為0.1μmol/L,dNTPs 50μ

9、mol/L,總反應(yīng)體積為30μl。擴(kuò)增條件:95℃預(yù)變性180s,94℃ 60s,56℃ 75s,72℃ 70s擴(kuò)增35個循環(huán),最后72℃延伸7min。取第一輪擴(kuò)增產(chǎn)物1μl為模板進(jìn)行第二輪擴(kuò)增,方法條件均同第一輪(引物為HE1和HE3)。兩輪產(chǎn)物各取10μl,用含溴化乙錠的1.4%的瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈下觀察結(jié)果。 </p><p>  1.6 PCR產(chǎn)物的克隆與序列測定 用低熔點(diǎn)瓊脂糖凝膠法回收第二輪PCR

10、擴(kuò)增產(chǎn)物,經(jīng)純化,連接到pGEM-T載體(美國Promega公司產(chǎn)品)上;將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化感受態(tài)宿主E.coli XL1-blue(美國Ivitogens公司產(chǎn)品),轉(zhuǎn)化子在含X-gal和IPTG(美國Promega公司產(chǎn)品)的平板上以藍(lán)、白斑法篩選。挑取白色菌落,以HE1和HE3為引物做PCR快速鑒定,取陽性克隆,液體培養(yǎng)增菌;用QIApreg試劑盒(德國QIAGEN公司產(chǎn)品)提取雙鏈重組質(zhì)粒DNA,應(yīng)用373A自動測序儀測序。 <

11、;/p><p>  1.7 DNA同源性比較 通過Internet網(wǎng)進(jìn)入美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)站點(diǎn)后,利用BLAST工具,與GenBank中注冊的核苷酸序列進(jìn)行比較。 </p><p><b>  2 結(jié)果 </b></p><p>  2.1 蜱標(biāo)本檢測結(jié)果 對不同來源的蜱標(biāo)本先分批進(jìn)行檢測然后統(tǒng)一進(jìn)行試驗(yàn),重復(fù)檢測的結(jié)果與分批檢測

12、的結(jié)果一致性良好。對個別結(jié)果有差異的標(biāo)本,再進(jìn)行第三次試驗(yàn),以最后一次結(jié)果為準(zhǔn)。從福建山麂、山羊、野兔、水牛體表采集的越原血蜱成蜱及從草地采集的游離越原血蜱成蜱標(biāo)本中擴(kuò)增出目的DNA片段(圖1)。共檢測越原血蜱成蜱616只(240組),31組陽性,按每組至少有1只蜱陽性計算,則最小陽性率為5.0%。檢測卵形硬蜱成蜱68只,中華硬蜱成蜱23只,豪豬血蜱成蜱14只,粒形硬蜱成蜱4只,均未檢出查菲埃立克體DNA。檢測越原血蜱若蜱30只,結(jié)果均

13、為陰性。 </p><p>  2.2 動物臟器及血塊標(biāo)本檢測結(jié)果 共檢測野鼠脾臟標(biāo)本39份,有22份陽性,陽性率為56.4%。檢測上述野鼠的血塊標(biāo)本共31份,13份(38.7%)陽性。脾臟和血塊均陽性的鼠有8只。6種鼠中,社鼠的檢出陽性率最高。另外,檢測野兔血塊標(biāo)本4份,2份為陽性(表1)。代表性標(biāo)本擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果。 </p><p>  2.3 測序分析及結(jié)果 選擇越原血蜱陽性標(biāo)本2

14、份,野鼠脾臟和血塊陽性標(biāo)本各1份,經(jīng)半套式PCR擴(kuò)增后,對390bp的DNA片段進(jìn)行克隆和序列測定。4份標(biāo)本測序結(jié)果完全一致。將測定的DNA序列輸入BLAST分析程序,在GenBank中搜索,進(jìn)行最大同源性比較,結(jié)果發(fā)現(xiàn)與查菲埃立克體美國分離株16SrRNA基因?qū)?yīng)片段完全一致。 </p><p><b>  3 討 論 </b></p><p>  PCR用于查菲埃

15、立克體研究領(lǐng)域國內(nèi)外均有報道,但是將此種半套式PCR技術(shù)應(yīng)用于流行病學(xué)調(diào)查,檢測現(xiàn)場野生動物內(nèi)臟及血塊中的查菲埃立克體國內(nèi)尚未見報道。從16Sr RNA基因序列高變區(qū)構(gòu)建的針對查菲埃立克體的特異引物HE1和PER2及HE3,具有很高的特異性,僅能擴(kuò)增查菲埃立克體DNA,而對其它埃立克體種16S rRNA基因都不能擴(kuò)增[5]。用此半套式PCR技術(shù)檢測現(xiàn)場采集的越原血蜱、野鼠脾臟和血塊及野兔血塊,結(jié)果均獲得了查菲埃立克體特異的DNA片段,而

16、從人粒細(xì)胞埃立克體及斑點(diǎn)熱立克次體DNA中擴(kuò)增不出特異片段。同時,用有限稀釋法,對這兩對引物的半套式PCR敏感度進(jìn)行評價,結(jié)果顯示:最低能檢測到4個拷貝的查菲埃立克體DNA。由于查菲埃立克體為專性細(xì)胞內(nèi)寄生菌,分離培養(yǎng)甚為困難。極大地限制了對它的研究。因此,對于這種一般實(shí)驗(yàn)室難以檢測而且分離成功率極低的病原體,半套式PCR及序列測定技術(shù)具有快速、簡便、靈敏、特異,對原始材料要求不高的特點(diǎn),為直接在蜱和野生動物中檢測和鑒定查菲埃立克體提供

17、了有力的手段。 </p><p>  本次及以前的研究[4]中,從野外采集的越原血蜱中檢測到查菲埃立克體DNA,是該種蜱自然感染的有力證據(jù)。越原血蜱是當(dāng)?shù)氐膬?yōu)勢蜱種,在我們采集到的蜱中占83.7%,作為傳播媒介的可能性很大。5.0%的最小陽性率與以前報道的4.3%的差別可能與樣本量及蜱中存在的抑制查菲埃立克體16S rRNA基因擴(kuò)增的物質(zhì)有關(guān)。因此,今后基于PCR的蜱查菲埃立克體DNA調(diào)查應(yīng)多檢測單只蜱,以更準(zhǔn)確

18、地估計感染率。 </p><p>  本次調(diào)查野鼠脾臟及動物血塊中查菲埃立克體DNA陽性率分別為56.4%和38.7%,J.Mitchell Lockhart等檢測美國佐治亞州22只白尾鹿脾臟及外周血的查菲埃立克體DNA陽性率分別為41%和18%[7],因?yàn)榈赜虿煌?,宿主動物不同,?biāo)本量不同,差別大是可能的,但在脾臟中比血塊中檢出率高這一點(diǎn)上兩者是一致的。這表明調(diào)查點(diǎn)鼠類及野兔可能感染查菲埃立克體,它們作為貯存宿

19、主的可能性值得重視。同時,因?yàn)樵皆绯<纳谂?、山羊等大型動物上,所以它們作為貯存宿主的可能性也不排除。因本次調(diào)查采集到的動物種類及數(shù)量均較少,缺少對人群的調(diào)查,所以更細(xì)致全面的流行病學(xué)調(diào)查還要繼續(xù)進(jìn)行。 </p><p>  總之,本研究結(jié)果說明,福建省可能存在查菲埃立克體的自然疫源地,越原血蜱和野鼠、野兔可能分別為其傳播媒介和貯存宿主,但應(yīng)進(jìn)一步從蜱類和野生動物及病人分離病原體,才能證實(shí)。然而,在該地區(qū)及具

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