版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡(jiǎn)介
1、磷是植物生長(zhǎng)的必需營(yíng)養(yǎng)元素,由于磷在土壤中不易移動(dòng),因此有效性比較低,是造成植物缺磷的主要原因。植物可以通過(guò)擴(kuò)大根系生長(zhǎng),分泌有機(jī)酸等一系列生理機(jī)制來(lái)提高對(duì)土壤中磷的利用率。除此之外,植物根系與菌根菌共生是植物適應(yīng)土壤缺磷的另一個(gè)重要機(jī)制。植物通過(guò)菌根菌大量伸展到土壤中的菌絲體吸收磷等礦質(zhì)營(yíng)養(yǎng)和水分,同時(shí)以光合產(chǎn)物作為交換輸送給菌根菌。
研究發(fā)現(xiàn),在植物根系與菌根菌識(shí)別并共生的過(guò)程中,包括了一系列的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程以及生理與分
2、子變化,有些變化與缺磷植物相似,而有些變化又與植物與微生物共生類似.而引起這些變化的調(diào)控過(guò)程及機(jī)理則還不清楚。
MicroRNAs(miRNAs)是一類新鑒定的、非編碼蛋白、長(zhǎng)度約為22nt的單鏈小RNA分子。最近的研究發(fā)現(xiàn)microRNA(miRNA)作為調(diào)控基因表達(dá)的調(diào)控因子參與了植物生長(zhǎng)和發(fā)育的各個(gè)方面,同時(shí)在一些非生物因子造成的脅迫,如養(yǎng)分缺乏過(guò)程中,甚至在豆科植物與固氮菌共生過(guò)程中都涉及到miRNA的變化等。但是
3、有關(guān)miRNA是否參與植物與菌根菌共生,以及與缺磷脅迫過(guò)程中miRNA的異同之處,則還未見(jiàn)報(bào)導(dǎo)。miRNA基因芯片是近幾年迅速發(fā)展起來(lái)的一種研究植物miRNA差異表達(dá)的技術(shù)手段,隨著植物中新miRNA不斷被發(fā)現(xiàn),運(yùn)用基因芯片可以更加迅速地為我們提供有關(guān)miRNA在植物生理變化過(guò)程中的信息。
在本研究中我們利用miRNA基因芯片分析了在缺磷、正常供磷和菌根菌侵染三種處理下番茄體內(nèi)miRNA的表達(dá),從中篩選到35個(gè)可能與菌根侵
4、染特異相關(guān)的miRNA.其中miR158、miR394、miR414、miR418、miR779.1、miR824、miR846、miR847、miR855在根中上調(diào),miR404在根中下調(diào),miR158、miR164、、miR172、miR173、miR319、miR396、miR398、miR407、miR415、miR420、miR771、miR775、miR778,miR829.1、miR832-3p、miR837-3p、miR
5、840、miR843、miR847、miR860、miR862-5p、miR865-5p、miR867在葉中上調(diào),miR168和miR851-3p在葉中下調(diào)。
再通過(guò)植物miRNA靶基因搜索服務(wù)器miRU(http:∥bioinfo3.noble.org/miRNA/miRU.htm)我們尋找到了其中14個(gè)miRNA的靶基因,進(jìn)一步通過(guò)與擬南芥數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行BLAST,預(yù)測(cè)到14個(gè)編碼已知功能蛋白質(zhì)的靶基因和7個(gè)編碼未知功能蛋
6、白質(zhì)的靶基因,經(jīng)分析后發(fā)現(xiàn)這14個(gè)蛋白質(zhì)中有5個(gè)是與代謝相關(guān)的蛋白質(zhì),5個(gè)是與轉(zhuǎn)錄因子相關(guān)的蛋白質(zhì),4個(gè)是與環(huán)境脅迫相關(guān)的蛋白質(zhì),1個(gè)是與細(xì)胞生長(zhǎng)相關(guān)的蛋白質(zhì),1個(gè)是與DNA加工相關(guān)的蛋白質(zhì),其中有2個(gè)蛋白質(zhì)與代謝和環(huán)境脅迫都相關(guān).
同時(shí),通過(guò)基因芯片我們還在根內(nèi)找到了14個(gè)與磷相關(guān)的miRNA,其中miR395、miR415、miR862-5p和miR866-5p上調(diào),miR159、miR162、miR166、miR16
7、7、miR168、miR396、miR399、miR834、miR840、miR862-3p下調(diào)。在葉中篩選到了12個(gè)相關(guān)的miRNA,其中miR163、miR404、miR414、miR418、miR472和miR855上調(diào),miR417、miR823、miR825、miR844*、miR845和miR853下調(diào)。經(jīng)預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)了16個(gè)編碼已知功能蛋白質(zhì)的靶基因和6個(gè)編碼未知功能蛋白質(zhì)的靶基因,經(jīng)分析后發(fā)現(xiàn)這16個(gè)蛋白質(zhì)中有9個(gè)是與代謝相
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫(kù)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 兩品種雞脂肪組織基因芯片和microRNA分析.pdf
- 接種菌根菌和供磷水平對(duì)砷脅迫下番茄的生長(zhǎng)及磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因表達(dá)的影響.pdf
- microRNA對(duì)hERG基因表達(dá)影響的研究.pdf
- 一種檢測(cè)microRNA表達(dá)的微陣列芯片的研制和microRNA122對(duì)肝癌細(xì)胞基因表達(dá)譜影響的研究.pdf
- 41951.基因芯片數(shù)據(jù)和基因表達(dá)分析
- 基于Affymetrix基因芯片的基因表達(dá)水平計(jì)算研究.pdf
- 外源性microRNA阻斷HBV和HBV復(fù)制相關(guān)的宿主基因表達(dá)對(duì)HBV復(fù)制水平的影響.pdf
- 番茄microRNA及其靶基因?qū)追N病毒侵染的反應(yīng).pdf
- 基于基因芯片的基因表達(dá)模式分析.pdf
- 菌根對(duì)番茄和水稻糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因表達(dá)的調(diào)控.pdf
- 基因芯片分析
- 人類microRNA基因DNA和RNA水平變異系統(tǒng)分析.pdf
- MicroRNA-143真核表達(dá)載體的構(gòu)建及對(duì)靶基因DNMT3A表達(dá)水平的影響.pdf
- 43073.基因芯片數(shù)據(jù)的預(yù)處理方法對(duì)基因表達(dá)譜后續(xù)分析的影響
- 番茄中microRNA的功能和應(yīng)用研究.pdf
- 番茄保守性microRNA對(duì)病毒侵染的響應(yīng).pdf
- 胃癌基因芯片差異表達(dá)基因的驗(yàn)證和篩選.pdf
- 葡萄microRNA164和microRNA171調(diào)控其靶基因的功能分析.pdf
- 宮頸癌基因芯片數(shù)據(jù)的差異表達(dá)和聚類分析實(shí)驗(yàn)
- 番茄—黃瓜花葉病毒互作分子機(jī)制研究ⅰ.番茄—cmv基因表達(dá)譜芯片構(gòu)建與應(yīng)用ⅱ.番茄microrna及其與cmv侵染的關(guān)系
評(píng)論
0/150
提交評(píng)論