宮頸癌基因芯片數(shù)據(jù)的差異表達(dá)和聚類分析實(shí)驗(yàn)

1、實(shí)驗(yàn)名稱：宮頸癌基因芯片數(shù)據(jù)的差異表達(dá)和聚類分析 實(shí)驗(yàn)名稱：宮頸癌基因芯片數(shù)據(jù)的差異表達(dá)和聚類分析實(shí)驗(yàn)?zāi)康?實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?.掌握 Gene Expression Omnibus 數(shù)據(jù)庫（GEO）的搜索及基因芯片數(shù)據(jù)的獲得方法。2.熟悉 MeV 軟件進(jìn)行差異表達(dá)分析及聚類分析的操作方法及結(jié)果解釋。3.熟悉網(wǎng)絡(luò)搜索工具，瀏覽器及生物信息中心，掌握醫(yī)學(xué)信息獲取途徑。實(shí)驗(yàn)方法和流程 實(shí)驗(yàn)方法和流程：一、 選擇研究基因選定感興趣的基因芯片數(shù)據(jù) 選定

2、感興趣的基因芯片數(shù)據(jù)：宮頸癌是常見的惡性腫瘤之一，嚴(yán)重危害人群的健康。研究顯示宮頸癌的發(fā)生發(fā)展是一個由多基因參與，通過多途徑作用，經(jīng)過多階段而逐漸演變的過程?；蛐酒鳛橐环N高效、大規(guī)模獲取生物信息的技術(shù)，能檢測和分析腫瘤與正常組織的差異表達(dá)基因。本研究利用公共基因芯片數(shù)據(jù)庫 GEO 中的芯片數(shù)據(jù)。對 宮頸癌基因芯片數(shù)據(jù)的差異表達(dá)和聚類分析。 ↓輸入網(wǎng)址 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ 進(jìn)入 G

3、EO 數(shù)據(jù)庫↓選擇 GEO DataSets 鍵入檢索詞 human and cervical cancer↓點(diǎn)擊 Search，進(jìn)入數(shù)據(jù)庫點(diǎn)擊 Large RS-like factor SON knockdown effect in HeLa cervical cancer cell line↓數(shù)據(jù)集編號二、 MeV 軟件操作1、 數(shù)據(jù)預(yù)處理，刪除 GDS4448.soft（可用 Excel 打開）里面非數(shù)據(jù)部分信息2、 打開 MeV