用基因芯片研究CLB處理的豬脂肪組織基因的差異表達(dá).pdf

1、鹽酸克倫特羅作為β-興奮劑的一種有害于人的健康在用于改善豬肉品質(zhì)時(shí),為了理解在鹽酸克倫特羅作用下間接或直接影響到那些基因從而很大程度上提高了瘦肉率、降低了脂肪率,因此我們用基因芯片技術(shù)分析了鹽酸克倫特羅處理的豬的脂肪組織以及肌肉組織基因的差異表達(dá).該實(shí)驗(yàn)我們首先創(chuàng)建了代表大約3500個(gè)用于功能基因組分析的豬基因微陣列.陣列中的元素來自6494個(gè)大規(guī)模表達(dá)序列標(biāo)簽的cDNA克隆,這些cDNA克隆來自均一化和消減后的豬脂肪cDNA文庫.通過

2、BLASTN進(jìn)行序列相似性搜索,在陣列中的3426個(gè)ESTs中比對出2790個(gè)ESTs是和人的同源,占81.4﹪,其余的是代表新基因或高度非同源的ESTs.通過對差異表達(dá)的基因的生物信息學(xué)的分析,我們找到了實(shí)驗(yàn)重復(fù)和芯片重復(fù)之間共表達(dá)的基因23個(gè),他們分別是與脂肪形成和和脂肪代謝、脂形成相關(guān)的重要的轉(zhuǎn)錄因子、幾個(gè)阿樸脂蛋白家族中的基因以及β-興奮劑調(diào)節(jié)的胞內(nèi)信號路徑中的幾個(gè)基因相關(guān).另外,我們還找到了20個(gè)未知功能的新基因.這些基因很可