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文檔簡介
1、生長激素受體基因是公認的調(diào)控動物生長發(fā)育的關(guān)鍵基因之一,其外顯子氨基酸編碼區(qū)引起生長激素受體氨基酸改變的SNP位點,必然會影響生長激素受體結(jié)構(gòu)的改變,從而影響GHR與GH之間的結(jié)合,進而影響動物的生長發(fā)育。本實驗以波爾山羊(202只)為主要研究對象,馬頭山羊為參考對象(20),對生長激素受體基因外顯子4、5、6、7、10進行PCR擴增,并利用PCR-SSCP技術(shù)進行了多態(tài)性的檢測,以期尋找到影響生長激素受體氨基酸組成的SNP位點。
2、> 本研究首先根據(jù)GnenBank上山羊GHR基因的序列信息,并運用在線引物設(shè)計軟件Primer3(http://frodo.wi.mit.edu/)設(shè)計各外顯子相應(yīng)的引物;然后利用PCR技術(shù)擴增目的片段,并通過瓊脂糖凝膠電泳檢測擴增片段是否與目的片段長度相一致;再利用DNA回收試劑盒回收目的片段,混合8-10個樣本進行目的片段序列測定;根據(jù)測定的結(jié)果尋找SNP位點,如果發(fā)現(xiàn)多態(tài)性位點,就可根據(jù)測序的結(jié)果尋找合適的內(nèi)切酶進行多態(tài)性
3、位點的驗證,基因分型以及分型后基因型和性狀間的關(guān)聯(lián)分析等研究。本實驗在測序之中未發(fā)現(xiàn)多態(tài)性位點,為了確定其可靠性,將擴增的目的片段進行了SSCP多態(tài)性分析。
研究結(jié)果如下:
1.exon 4研究結(jié)果:PCR目的片段包含外顯子4所有基因序列,測序結(jié)果與引物設(shè)計參考序列AY739707(Mai and Zwierzchowski 2006)比對顯示,與參考序列外顯子堿基完全相同;PCR-SSCP檢測也顯示本研究的
4、樣本內(nèi)未發(fā)現(xiàn)基因多態(tài)性位點。
2.exon 5研究結(jié)果:根據(jù)GeneBank序列DQ179241自行設(shè)計引物,該引物的目的片段包含了外顯子5所有的基因序列,擴增目的片段長度與預(yù)測長度一致。
3.exon 6研究結(jié)果:GeneBank序列DQ179242自行設(shè)計引物,外顯子6全部序列均包含在目的片段內(nèi)。目的片段長度與預(yù)測一致。
4.exon 7研究結(jié)果:根據(jù)序列DQ179243設(shè)計引物,外顯子序列
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