山羊肌肉生長(zhǎng)抑制素基因多態(tài)性及其與生產(chǎn)性能相關(guān)性研究.pdf

1、本研究以我國(guó)主要地方山羊品種及部分引入品種為研究對(duì)象，利用PCR技術(shù)，擴(kuò)增了山羊肌肉生長(zhǎng)抑制素基因(GenBank登錄號(hào)為DQ167575)，測(cè)序后對(duì)其序列的結(jié)構(gòu)、核苷酸組成及編碼的氨基酸進(jìn)行了初步研究，并利用Bioedit、Phylip等生物學(xué)軟件構(gòu)建了山羊MSTN基因進(jìn)化樹，同時(shí)對(duì)各品種山羊MSTN基因部分序列進(jìn)行了PCR-RFLP分析。研究結(jié)果表明： 1.利用PCR方法擴(kuò)增得到了山羊MSTN基因5211bp的DNA序列(D

2、Q17575)。有3個(gè)外顯子和2個(gè)內(nèi)含子，外顯子的大小分別為：373bp、374bp、381bp;內(nèi)含子分別為1834bp、2027bp。 2.在該序列中存在大量的熱休克應(yīng)答元件，山羊與牛、豬、馬、人、狒狒、狗、紅狐貍、家鼠、火雞、鵪鶉、鴨、鵝、雞、家鴿、大西洋鮭、鱸魚、大黃魚、斑馬魚、運(yùn)河鯰魚的MSTN基因編碼區(qū)核苷酸序列的同源性分別為96.37％、94.68％、93.53％、92.38％、92.29％、91.22％、90.6

3、0％、89.36％、82.98％、82.98％、82.89％、82.80％、82.35％、81.91％、38.21％、29.70％、27.59％、24.02％、23.59％，山羊的MSTN基因編碼375個(gè)氨基酸的多肽，并且所編碼的成熟肽具有與其它哺乳動(dòng)物相同的結(jié)構(gòu)，即在127個(gè)氨基酸的C末端有保守的蛋白酶水解位點(diǎn)RSRR，成熟肽中含有9個(gè)半胱氨酸。這表明MSTN蛋白在不同物種之間具有較強(qiáng)的保守性。 3.利用PCR-RFLP方法對(duì)

4、山羊MSTN基因的部分序列進(jìn)行了多態(tài)性分析，結(jié)果顯示在所有受試山羊中外顯子2和外顯子3沒有發(fā)現(xiàn)變異，在5’UTR、外顯子1和內(nèi)含子2序列中存在8個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)，它們分別是位于第217位后的TTTTA插入、第345位的T→A的轉(zhuǎn)換、第3617位的C→T、第3726位的C→A、第3783位的T→C、第4280位的T→C、第4600-4604堿基處發(fā)生了GCGAT→AGAAG的突變、第4794位的G→A的顛換。第345位的突變(外顯子1)為一沉

5、默突變。對(duì)這8個(gè)多態(tài)位點(diǎn)在不同山羊品種中的檢測(cè)結(jié)果表明：野生基因型(AA、CC、EE、GG、II、KK、MM、OO)在大部分群體中是優(yōu)勢(shì)基因型。 4.根據(jù)純合子的限制性態(tài)型，可以將其歸納為8種基因單倍型，單倍型Ⅱ(DraⅠ-A、CviAlⅠ-A、HphⅠ-A、MvaⅠ-A、Cac8Ⅰ-A、EcoRV-A、MboⅡ-B、MnlⅠ-A)和Ⅲ(DraⅠ-A、CviAⅡ-A、HphⅠ-A、MvaⅠ-A、Cac81-B、EcoRV-A、M

6、boⅡ-B、MnlⅠ-A)為兩種基本的單倍型，該結(jié)果提示我國(guó)地方山羊品種起源于兩種不同的祖先，其MSTN基因的遺傳多樣性比較貧乏，分化程度較低。 5.從MSTN基因遺傳多樣性角度來講，湖南省的馬頭山羊和廣東省的雷州山羊應(yīng)作為重點(diǎn)保護(hù)對(duì)象加以保護(hù)。 6.統(tǒng)計(jì)分析表明：MM和OO基因型個(gè)體的初生重顯著高于MN和OP基因型個(gè)體(p＜0.05)，DraⅠ、CviAⅡ、MboⅡ、Cac8Ⅰ各酶切位點(diǎn)的突變對(duì)初生重沒有顯著影響；KK

7、基因型個(gè)體的斷乳重顯著高于KL和LL基因型個(gè)體(p＜0.05)，DraⅠ、CviAⅡ、MboⅡ、EcoRV、MvaⅠ各酶切位點(diǎn)的突變對(duì)斷乳重沒有顯著影響；各單倍體型中，AACCEEGGIILLMMOO單倍體型與其它單倍體型、AACCEEGGIIKKMMOO與AACDEEGGIIKKMMOO、AACCEEGGIIKLMMOP與AACDEEGGIIKKMMOO、AACCEEGGIIKLMMOP與ABCCEEGGIIKKMMOO、AACCEE