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文檔簡介
1、視黃酸(RA)是維生素A的活性代謝產物并且具有一些重要的生理功能包括細胞增殖和凋亡、細胞分化和組織形態(tài)學變化。RA的合成和分解主要受視黃醛脫氫酶(RALDHs)和細胞色素P450家族Cyp26氧化酶(Cyp26s)中Aldh1a2和Cyp26a1這兩個主效基因的調控,他們共同協(xié)調維持動物體內RA的穩(wěn)態(tài)。RA廣泛參與胚胎發(fā)生和生長等重要生物學進程,過多或過少的RA對成體動物的視覺、皮膚、免疫、生殖、神經(jīng)等系統(tǒng)的正常功能都有影響,他的這些特
2、性已使他被開發(fā)利用于皮膚病等眾多疾病的臨床治療,并使其成為預防癌癥和分化治療的一大候選分子。
補體由血漿補體成分、可溶性和膜型補體調節(jié)蛋白、補體受體等30余種糖蛋白組成,是一個具有精密調控機制的蛋白質反應系統(tǒng)。該系統(tǒng)可通過3條既相對獨立又相互聯(lián)系的途徑被激活,從而發(fā)揮調理吞噬、裂解細胞、介導炎癥、免疫調節(jié)和清除免疫復合物等多種生物學效應。C4是補體經(jīng)典激活途徑的一個重要組分,由兩個基因C4A和C4B所編碼。
3、本實驗利用RACE巢式PCR技術克隆了洪澤湖鵝的視黃酸新陳代謝酶的Aldh11 a2和Cyp26a1和補體C4-1這三個基因的cDNA序列,利用生物信息學方法預測了蛋白的結果和功能,并進行了同源性序列多重比對和分子系統(tǒng)發(fā)生分析。利用實時熒光定量(Real-time)PCR技術分別測定了Aldh1a2、Cyp26a1、C4-1在成體鵝各主要組織器官中mRNA相對表達水平。為研究鵝的Aldh1a2、Cyp26a1、C4-1基因的生物學功能和
4、科學應用提供基礎的基因信息,并探討了克隆的基因在物種進化進程中的同源性,也為研究人類患相關疾病建立動物實驗模型提供醫(yī)學參考。
1. Aldh1a2,Cyp26a1和C4-1基因的克隆測序
分別用多種動物的基因核苷酸序列通過JELLYFISH上BLAST同源性檢索,獲得相關的序列,基此設計RACE引物,利用RACE技術克隆測序,獲得鵝Aldh1a2基因的cDNA全序列,長度為3369bp;獲得Cyp26a1基因
5、的cDNA部分序列,長度為1328bp;獲得C4-1基因的cDNA全序列,長度為4979bp。
2. Aldh1a,Cyp26a1和C4-1蛋白的生物信息學分析
借助生物信息學網(wǎng)絡資源和軟件,預測出鵝Aldh1a2基因開放閱讀框的長度為1500bp bp,編碼500個氨基酸殘基,且兩側分別是112bp的5'UTR和1757bp的3'UTR;預測出Cyp26a1基因部分長度為1058bp,3'UTR為270bp
6、;預測出C4-1基因開放閱讀框的長度為4899bp,編碼1633個氨基酸的蛋白,且兩側分別是80bp的5'UTR和0bp的3'UTR。推測蛋白具有DNA結合活性,參與基因轉錄調控。
3. Aldh1a2、Cyp26a1、C4-1基因在不同組織的表達
采用實時熒光定量PCR技術,分別分析了鵝Aldh1a2、Cyp26a1、C4-1基因在不同組織中的相對表達水平,結果表明:Aldh1a2、Cyp26a1、C4-1
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