兩種水稻黑條矮縮病毒在我國的分布及其遺傳多樣性.pdf

1、近年來，水稻黑條矮縮病毒(Rice black-streaked dwarf virus，RBSDV)和南方水稻黑條矮縮病毒(Southern rice black-streaked dwarf virus，SRBSDV)成為危害我國水稻和玉米生產(chǎn)的兩種重要病毒，造成了嚴(yán)重?fù)p失。為了探明這兩種病毒在我國的分布，我們于2009～2010年期間，利用RT-PCR技術(shù)對采自我國廣東、福建、江西、浙江、湖南、江蘇、安徽、山東、河北等共計17個省

2、份，161個市/縣/區(qū)的1524份表現(xiàn)為矮縮癥狀的水稻、玉米植株進(jìn)行了檢測。其中1414份樣品采自水稻田，涉及313個水稻品種，110份樣品采白玉米田。檢測結(jié)果顯示21.00％的樣品感染RBSDV，55.97％的樣品感染SRBSDV。RBSDV主要在上海、江蘇、山東、河北、浙江、安徽、江西等地為害水稻和玉米。尤其在江蘇地區(qū)，RBSDV幾乎遍布全省。SRBSDV主要在以種植秈稻為主的長江以南地區(qū)為害水稻，在南方的13個省份、115市/縣/

3、區(qū)均檢測到該病毒。在水稻播種期與白背飛虱主要遷入期間隔一個月左右及種植方式多樣化的地區(qū)SRBSDV分布更為廣泛。兩種病毒可侵染常規(guī)粳稻、常規(guī)秈稻、雜交粳稻、雜交秈稻、常規(guī)糯稻等，生產(chǎn)中尚未見對這兩種病毒高抗的水稻類型或品種。
　　 在明確我國RBSDV分布情況的基礎(chǔ)上，同時選取部分分離物通過核苷酸序列測定方法對其CP、S7-ORF1和S5-ORF2進(jìn)行了遺傳多樣性分析。結(jié)果表明，RBSDVCP遺傳多樣性值為0.0400，系統(tǒng)發(fā)育

4、樹表明各地分離物可明顯的分為兩組；S7-ORF1序列的遺傳多樣性值為0.0179，不同分離物也可分為兩組，多數(shù)分離物都聚集在一組內(nèi)，與中國分離物的核苷酸和氨基酸序列相似性在98％以上，個別分離物的核苷酸和氨基酸序列與日本分離物的相似性較高，分別為94.3～99.0％和98.5～100％；S5-ORF2的遺傳多樣性值為0.0285，各地分離物也可以明顯的分為兩組。RBSDV分離物CP，S5-ORF2的分組情況與地理來源有一定的相關(guān)性，多數(shù)

5、來源于北方玉米種植區(qū)的分離物聚于一組而來源于地理位置偏南以種植水稻為主的地區(qū)的分離物聚于一組。來源于山東、江蘇地區(qū)的分離物的CP、S5-ORF2遺傳多樣性水平相對較高。同一分離物不同片段的分組情況和遺傳多樣性水平也不相同。三個片段在遺傳多樣性方面CP>S5-ORF2>S7-ORF1。三者的進(jìn)化限制系數(shù)ω值依次為0.0488、0.0394、0.4278，在受到的選擇壓力方面：S7-ORF1>CP>S5-ORF2。S7-ORF1序列的高度保

6、守性可能與其編碼蛋白的功能有關(guān)。
　　 采用類似方法對采自我國13個省份的SRBSDV水稻、玉米分離物的S10-ORF，S7-OR目的變異情況進(jìn)行了分析。將測定的我國SRBSDV分離物的CP和S7-ORF1序列與從Genbank中獲得的越南分離物比較，發(fā)現(xiàn)無論是我國的分離物是越南的分離物，這兩個片段不同分離物之間的核苷酸序列和氨基酸序列的相似性都較高，均在97％以上，不同地理和寄主來源的分離物間差異較小。兩個片段的核苷酸遺傳多樣