兩品種雞生長模型探析及PGC-1α基因與肉品質及其相關基因表達的關聯(lián)分析.pdf

1、以我國著名優(yōu)質地方品種清遠麻雞和國外引進的快大型品種隱性白羽雞為研究對象,用Logistic模型、Gompertz模型和Von Bertalanffy模型對體重和脛長進行了生長曲線的擬合,并比較了3種模型擬合效果的優(yōu)劣;測定了肌內(nèi)脂肪含量、剪切力和胸肌失水率等肉品質指標:對影響肉品質的一個關鍵候選基因PGC-1α(peroxisome proliferators activated receptor gamma coactivator-

2、1 alpha,過氧化物酶體增殖物活化受體Y輔激活因子1-α)進行SNP位點篩查,并與肉質性狀進行關聯(lián)分析,找出對肉品質有重要影響的多態(tài)性位點;分析了PGC-1α基因以及與肌纖維類型相關的不同亞型的肌球蛋白重鏈(MyHC)基因(FWM(fast whight muscle)基因、FRM(fast red muscle)基因和SM(slow muscle)基因)在肌肉組織中的發(fā)育表達規(guī)律,并分析了PGC-1α基因表達與FWM基因、FRM基

3、因和SM基因的相關性。主要研究結果如下:
　　 1.用Logistc模型、Gompertz模型和Von Bertalanffy模型對隱性白羽雞和清遠麻雞的體重和脛長進行生長曲線擬合,發(fā)現(xiàn)0周齡-4周齡隱性白羽雞的體重用VonBertalanffy模型擬合效果最好,5周齡-14周齡隱形白羽雞的體重以及0周齡-14周齡清遠麻雞的體重用Gompertz模型擬合效果最好。隱性白羽雞和清遠麻雞的脛長均是Logistci模型的擬合效果最好。

4、
　　 2.Gompertz模型對隱性白公、母雞和清遠麻公、母雞體重擬合的拐點周齡分別為8.6周齡、8.6周齡、8.5周齡和9.0周齡,四者相差不大。Logistic模型對隱性白公、母雞和清遠麻公、母雞脛長擬合的拐點周齡分別為4.2周齡、4.0周齡、4.2周齡和3.6周齡,四者相差也不大。隱性白的最大周增重比清遠麻的最大周增重約100 g。
　　 3.各周齡的體重和脛長的相關分析表明,2周齡的體重與3周齡-14周齡的體重

5、之間的相關均極顯著(P＜0.01),R2值為0.8;3周齡的脛長與3周齡-14周齡的體重之間的相關也均極顯著(P＜0.01),R2值為0.8,因此可以通過對早期體重和脛長的個體選擇,達到挑選出上市日齡較大體重的目的。
　　 4.用PCR-SSCP結合直接測序法對PGC-1α基因13個外顯子和部分內(nèi)含子進行SNP位點篩查,與Genbank中的DNA序列(登錄號:NW001471687)比對,共發(fā)現(xiàn)了13個突變位點,分別是:SNP0

6、(G5407189A)、SNP1(G5368254A)、SNP2(C5377373T)、SNP3(C5405129T)、SNP4-1(T5406152c)、SNP4-2(A5406203G)、SNP5(G5407235A)、SNP6-1(C5411336T)、SNP6-2(A5411345G)、SNP8(A5419140G)、SNP13(G5420542A)、SNP14(T5420953C)和SNP15(G5430392A)。其中SNP

7、0、SNP2、SNP3、SNP4-1、SNP6-1、SNP6-2和SNP8位點處于外顯子中,屬于沉默突變;SNP4-2、SNP5和SNP15位點處于外顯子中,分別導致了氨基酸序列R173G、D216N和R673H的變異;SNP1、SNP13和SNP14位點處于內(nèi)含子中。
　　 隱性白和清遠麻兩個品種中各突變位點的基因型分布均符合哈代-溫伯平衡定律(P＞0.05);品種之間除了SNP8位點外,其他位點基因型分布差異均極顯著。兩個品

8、種各突變位點的優(yōu)勢等位基因相同。隱性白羽雞和清遠麻雞PGC-1α基因的平均多態(tài)信息含量含量分別為0.088和0.133,屬于低度多態(tài)位點。
　　 5.隱性白羽雞和清遠麻雞肉品質的分析
　　 對7周齡隱性白公母雞、17周齡隱性白公母雞和17周齡清遠麻公母雞進行常規(guī)肉品質檢測與分析。7周齡隱性白公、母雞之間肌內(nèi)脂肪含量、剪切力和胸肌失水率差異均不顯著;17周齡隱性白公雞的剪切力極顯著高于母雞的,胸肌失水率極顯著低于母雞的,肌

9、內(nèi)脂肪含量的差異不顯著。17周齡清遠麻公雞的剪切力極顯著高于母雞的,肌內(nèi)脂肪含量和胸肌失水率沒有顯著差異。
　　 隱性白羽雞17周齡的肌內(nèi)脂肪含量極顯著高于7周齡的,剪切力和胸肌失水率均極顯著低于7周齡的。17周齡清遠麻的脂肪含量極顯著低于7周齡隱性白的,但絕對值相差不大,而剪切力和胸肌失水率均極顯著低于7周齡隱性白的。17周齡清遠麻的脂肪含量和剪切力均顯著低于17周齡隱性白的,胸肌失水率沒有較大差異。
　　 6.對檢測

10、到的突變位點進行肉質關聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn):
　　 SNP3、SNP4-1、SNP6、SNP8、SNP13和SNP14對肉品質沒有顯著影響,SNP0、SNP1、SNP2、SNP4-2、SNP5和SNP15都對肉品質有一定影響。
　　 ①SNP0位點對7周齡隱性白公雞的剪切力有顯著影響,其中AA基因型的剪切力極顯著小于AG基因型和GG基因型的;其它種群的公母雞的剪切力在該位點基因型差異不顯著。
　　 ②SNP1位點與品種、

11、性別的三階交互作用對胸肌失水率的影響顯著,但在各品種性別中,胸肌失水率在基因型之間的差異不顯著。
　　 ③SNP2位點對脂肪含量有顯著影響,其中CC基因型的含量顯著高于CT基因型的。該位點清遠麻母雞的胸肌失水率也有影響,其中CC基因型的胸肌失水率極顯著高于CT基因型的。
　　 ④SNP4-2位點與品種、性別的三階交互作用對胸肌失水率的影響顯著,但在各品種性別中,胸肌失水率在基因型之間的差異不顯著。
　　 ⑤SNP

12、5位點對7周齡隱性白羽雞的胸肌失水率有極顯著影響,其中AA基因型和AG基因型的胸肌失水率極顯著高于GG基因型的,AA基因型和AG基因型之間沒有顯著差異,AG基因型的顯著高于GG基因型的。該位點對17周齡清遠麻雞的胸肌失水率也有極顯著的影響,AA基因型的胸肌失水率極顯著高于AG基因型和GG基因型的。17周齡隱性白羽雞中沒有發(fā)現(xiàn)胸肌失水率在該位點基因型之間的顯著差異。
　　 ⑥SNP15對剪切力有極顯著的影響,其中AA基因型的剪切力

13、極顯著低于AG基因型和GG基因型的,AG基因型和GG基因型之間差異不顯著。
　　 7.用SYBR GreenⅠ熒光定量法對清遠麻、隱性白0周齡-12周齡。PGC-1α基因和與肌纖維類型相關的FWM基因、FRM基因、SM基因進行了表達水平的相對定量。心肌、胸肌和腓腸肌中PGC-1α基因的表達量在不同性別中隨周齡變化趨勢相同,在不同品種中隨周齡變化趨勢不同。隱性白、清遠麻腓腸肌中PGC-1α基因0周齡-2周齡表達量下降,2周齡-10

14、周齡表達量趨于平穩(wěn),10周齡-12周齡又開始上升。隱性白上升的幅度較清遠麻為大。FWM基因和FRM基因在腓腸肌中的整體變化趨勢呈“U”型,早期表達量比較高,到8周齡時表達量最低,然后又開始回升。SM基因在腓腸肌中的表達量沒有一定的規(guī)律,但在8周齡時的表達量也較低。
　　 8.在隱性白公雞腓腸肌中,PGC-1α基因與FWM基因表達量呈極顯著負相關,相關系數(shù)為-0.719,與FRM基因表達量呈極顯著正相關,相關系數(shù)為0.748;在隱