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文檔簡介
1、廣西南丹瑤雞是廣西優(yōu)良的地方品種之一,其特點是皮薄、肉質(zhì)好。PGC-1α是脂肪沉積和能量代謝的關(guān)鍵因子,其編碼區(qū)646位點的多態(tài)性與脂肪沉積量高度相關(guān)。為了探討PGC-1α基因?qū)V西南丹瑤雞脂肪沉積的調(diào)控,本研究克隆和分析了廣西南丹瑤雞PGC-1α基因編碼區(qū)(CDS)的全序列,檢測了雞PGC-1α基因編碼區(qū)646位點的多態(tài)性,探討了PGC-1α和PPARγ基因在PGC-1α基因646位點不同基因型中的表達。
PCR擴增并克隆獲
2、得廣西南丹瑤雞PGC-1α基因CDS序列。與GenBank上的參考序列(NM_001006457.1)相比存在10處堿基突變,其中T51C, T81C, T90C, C111T, T465C, C741T, C1572G7處為同義突變, G646A,T1579G,T1720C3處為錯義突變,分別造成天冬氨酸突變?yōu)樘於0?,絲氨酸突變?yōu)楸彼?,絲氨酸突變?yōu)楦彼?。用STRING軟件預(yù)測,發(fā)現(xiàn)廣西南丹瑤雞PGC-1α與PPARγ蛋白存在互作
3、。
以廣西麻雞作為對照,利用PCR-RFLP技術(shù)分析了廣西南丹瑤雞PGC-1α基因646位點的多態(tài)性。結(jié)果顯示,廣西南丹瑤雞和廣西麻雞PGC-1α基因646位點都存在A和G兩個等位基因,A等位基因頻率在廣西南丹瑤雞和廣西麻雞分別為0.35和0.23。兩個等位基因組成AA、AG和GG三種基因型,其頻率在廣西南丹瑤雞分別為0.05,0.60,0.35,在廣西麻雞分別為0.07,0.33,0.6。
利用熒光定量PCR(QP
4、CR)技術(shù)分析了PGC-1α和PPARγ基因在廣西南丹瑤雞PGC-1α基因646位點三種不同基因型的肝臟、皮膚和腹脂中的表達。結(jié)果顯示,在肝臟組織中,PGC-1α和PPARγ在PGC-1α基因編碼區(qū)646位點不同基因型中的表達趨勢一致,兩個基因在AA型中的表達量都顯著高于GG型和GA型(P<0.05)。在皮脂組織中,PGC-1α基因在AA型個體中的表達量顯著高于AG型和GG型(P<0.05),而PPARγ在AG型和GG型中的表達量則顯著
5、高于AA型(P<0.05)。在腹脂中,PGC-1α和PPARγ基因在AG型和GG型中的表達量都顯著高于AA型(P<0.05)。
綜上所述,本研究成功克隆廣西南丹瑤雞PGC-1α基因編碼區(qū)序列,全長為2388bp;與GenBank的參考序列(NM001006457.1)相比存在10處突變,其中7處為同義突變,3處錯義突變;生物軟件預(yù)測發(fā)現(xiàn)廣西南丹瑤雞PGC-1α與PPARγ蛋白存在互作;廣西南丹瑤雞PGC-1α基因區(qū)646位點的
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