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1、該研究采用RT-PCR技術(shù)對(duì)來自廣西不同地區(qū)的120份健康豬扁桃體和84份流產(chǎn)胎兒進(jìn)行CSFV檢測(cè),從得到的9份陽性病料中選取6份進(jìn)行豬瘟病毒E2全基因的擴(kuò)增、克隆、測(cè)序和遺傳學(xué)分析,得到長度為1119 bp、編碼373個(gè)氨基酸殘基的目的基因片段.應(yīng)用DNAstar序列分析軟件對(duì)所測(cè)定的6個(gè)廣西毒株與已知序列的HCLV、Shimen等毒株的相應(yīng)片段進(jìn)行同源性分析比較.結(jié)果顯示,HCLV與Shimen核苷酸和推定的氨基酸的同源性分別為95
2、.5%和94.6%,廣西株與HCLV、Shimen株的核苷酸同源性分別為92.5%~96.6%和89.8%~93.9%,推定的氨基酸同源性分別為90.0%~98.4%和86.3%~94.1%.廣西毒株之間核苷酸和推定的氨基酸同源性分別為93.1%~99.6%和86.3%~99.2%.說明廣西毒株之間的同源性很高,而廣西毒株與Shimen之間同源性比較低,但與HCLV同源性較高.6個(gè)廣西毒株E2基因的所有Cys位點(diǎn)都沒變,可推測(cè)CSFV
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