四種笛鯛rDNA-ITS1測序和Cytb-PCR-SSCP初步分析.pdf

1、本研究以南海海域四種常見笛鯛，即 約氏笛鯛（Lutjanus johni）、千年笛鯛（Lutjanus sebae）、金帶笛鯛（Lutjanus fulvus）、星點(diǎn)笛鯛（Lutjanus stellatus）為研究對象，采用兩種核酸分子標(biāo)記方法，rDNA-ITS1測序分析和Cytb-PCR-SSCP進(jìn)行分子標(biāo)記和遺傳多樣性的研究。所得結(jié)果如下： （1）采用PCR-DNA測序技術(shù)對四種笛鯛rDNA-ITS1序列進(jìn)行分析。測得序列

2、長度分別為：L.fulvus, 809bp; L.johni, 752bp; L.sebae, 693bp; L.stellatus, 775bp。在進(jìn)行序列比對后發(fā)現(xiàn)種內(nèi)序列差異性很小，而種間序列差異性較大，這與現(xiàn)有的對其他物種的研究結(jié)果是類似的。種間序列差異性顯著，表明笛鯛rDNA-ITS1基因間隔區(qū)具有很高的突變率，系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系復(fù)雜。同時，也說明這一基因間隔區(qū)可以作為一個精細(xì)的分子指標(biāo)用于屬內(nèi)種間的分子鑒定和系統(tǒng)學(xué)分析。

3、（2）采用聚丙烯酰胺凝膠電泳技術(shù)對四種笛鯛的Cytb部分基因片段進(jìn)行 PCR-SSCP分析，Cytb基因片段擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測。大小均在380bp左右，而擴(kuò)增產(chǎn)物變性后的聚丙烯酰胺凝膠電泳圖譜顯示了種內(nèi)不同個體間的單鏈構(gòu)象變化，從而說明了種內(nèi)存在不同的基因型。結(jié)果如下：星點(diǎn)笛鯛有4種基因型，千年笛鯛有5種基因型，約氏笛鯛有2種基因型，金帶笛鯛有4種基因型。由于SSCP可能會造成漏檢，因此，從圖譜的結(jié)果來看，不能說就