蕺菜屬資源rDNA ITS序列分析.pdf

1、蕺菜為三白草科蕺菜屬(HouttuyniacordataThunb.)植物，具清熱解毒、消癰排膿、利尿通淋等功能。四川省為蕺菜的主要產(chǎn)區(qū)之一。據(jù)《中國植物志》和《四川植物志》，蕺菜屬植物僅蕺菜HouttuyniacordataThunb.1種：2001年，祝正銀和張士良在峨眉山發(fā)現(xiàn)蕺菜屬新種峨眉蕺菜HouttuyniaemeiensisZ.Y.zhuetS.L.Zhang。該種在峨眉、樂山等地俗稱白側(cè)耳根，也作蔬菜和魚腥草藥用。

2、 四川和重慶地區(qū)的蕺菜資源分布很廣，遺傳多樣性較大，存在11種不同細胞型和2種不同化學(xué)型。本研究對四川和重慶地區(qū)的23份蕺菜屬資源的核糖體DNA(rDNA)ITS區(qū)序列進行分析，探討其與蕺菜細胞型和化學(xué)型間關(guān)系。得到以下主要結(jié)果： 1.對23份蕺菜屬資源進行rDNAITS序列分析，得到147條ITS序列，長度范圍為670～684bp。其中，ITS1的長度變異范圍為231～245bp，5.8SrDNA和ITS2的長度均分別為164

3、bp、275bp。GC含量在所測材料中為55.5％～56.9％，平均值為56.4％；其中，ITS1區(qū)的變化范圍為54.7％～56.3％，ITS2區(qū)為58.9％～60.4％，其平均值分別為55.8％和59.8％；5.8SrDNA為51.2％～52.8％，平均值51.8％。 2在所測23份蕺菜屬資源材料的ITS區(qū)(含5.8SrDNA)的147條序列中，共有48個信息位點和136個變異位點，分別占總序列的7.02％和19.9％。其中I

4、TS1具有22個信息位點和56個變異位點，分別占3.22％和8.19％；ITS2有16個信息位點和40個變異位點，分別占2.34％和5.85％；5.8SrDNA有8個信息位點和16個變異位點，分別占1.17％和2.33％。 3.除W01-16、W01-100、和W100-37的個別序列外，其余每份材料的各ITS序列長度均相同。W01-16、W01-100和W100-37的個別ITS序列長度的變異均位于ITS1，ITS2和5.8S

5、rDNA均無長度上差異。W100-37的ITS1長度在所測序列中變化范圍最大，為231～245bp。其中，以W01-37-7的ITS1長度最短(231bp)。 4.所有蕺菜材料細胞型(包括A,B，C，D，E，F(xiàn)，GH，I，J和K)內(nèi)GS值分別為0.0056、0.0040、0.0096、0.0077、0.0091、0.0137、0.0092、0.0069、0.0093、0.0058和0.0089，平均值為0.0082。以染色體數(shù)目

6、為82的細胞型類內(nèi)GS值最大(0.0137)，其次是染色體數(shù)目為72的細胞型(0.0096)，染色體數(shù)目為54的細胞型內(nèi)GS最小(0.0040)。 5.比較這11種不同細胞型的ITS序列可發(fā)現(xiàn),5.8SrDNA序列高度保守，而ITS1和ITS2核苷酸序列變化較大。細胞型內(nèi)ITS序列變異比細胞型間變異小。染色體數(shù)目小于72的材料比染色體數(shù)目大于或等于72的材料變異位點數(shù)目少。進一步分析發(fā)現(xiàn)，不同細胞型蕺菜材料類間GS值以染色體數(shù)目

7、為36和82的細胞型間最大，為0.0149：以染色體數(shù)目為36和54的細胞型間最小，為0.0051。 6.以白苞裸裸蒴AF203628為外分類群，根據(jù)蕺菜屬資源ITS序列遺傳相似系數(shù)，采用鄰接法(neighboringmethod)進行聚類分析發(fā)現(xiàn)，基于ITS序列劃分的類群與細胞型間存在一定關(guān)系，所有供試材料的ITS序列可分為5類。其中，A類包括除w01-99，w01-45和w01-71外的所有材料，B類材料染色體數(shù)大于或等于7

8、2；W01-81-1、W01-81-3和W01-81-4分別單獨聚為一類。試驗結(jié)果還表明，基于ITS序列劃分的類群與化學(xué)型間也存在一定關(guān)系。 7.聚類圖表明，同一份材料的幾個不同TTS序列往往分布在不同的大類中，故利用rDNAITS)芋列不能將23份不同材料全部區(qū)分開，且峨眉蕺菜W01-86與染色體數(shù)目為36的蕺菜材料W01-9、W01-22和W01-48在ITS序列上無顯著差異。試驗結(jié)果還表明，蕺菜屬資源根據(jù)rDNAITS區(qū)劃