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文檔簡介
1、中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所博士后研究工作報告AnalysisofmicroRNAexpressionduringtransdifferentitationMonikaHeiner工作完成時間2Q!至生至Q旦2Q旦報告提交時間2Q至2生至Q旦至Q旦AbstractRecently,severaIstudieshavedemonstratedthatterminallydifierentiatedsomaticc
2、ellscanbedirectlyconvertedintoothercelltypesbytheexpressionofdefinedfactorsExamplesofthistransdifferentiationincludesconversionofdifferentiatedcellsintoneurons,cardiomyocytes,bloodprogenitorcells,hepatocytes,andepiblasts
3、temcells(HanetaL,2011:HuangetaL,2011;ledaetaL,2010:Sekiya&Suzuki,2011;SzaboetaL,2010:Vierbuchen&Wernig,2012)Mousefibroblastcellsforinstancecanbeconvertedtofunctionalhepatocyte—likecellsbythetransductionofthreetranscripti
4、onfactors(Huangeta1,2011)Improvingtheefficiencyoftheconversion,however,especiallywithregardtopotentialclinicalapplicationsisstillamajorconcernInthisstudy,wewanttoanalyzemicroRNAexpressionprofilesduringtransdifferentiatio
5、nofmousefibroblastcellsbynext—generationsequencingInthissystemweexpecltogainnewinsightsonhowmicroRNAsareregulatedsincemicroRNAscanbeconsideredkeyplayersinmanybiologicalprocessessuchascellcyclecontrol,cellgrowthanddiffere
6、ntiation,metabolism,apoptosis,andembryodevelopment(Bartel,2009)Furthermore,recentresultssuggestthatbesidestranscriptionfactors,expressionofmicroRNAsalonecandirectlyconvertcelltypes(JayawardenaetaL,2012:MiyoshietaL,2011:Y
7、ooetaL,2011)MicroRNAexpressionprofilingmayalsoprovideUSwithabetterunderstandingoftheprocessofdirectconversionofcelltypeswiththeemphasisonimprovingefficiencyMicroRNAexpressionanalysiswasdoneontheIlluminaGenomeAnalyzerwith
8、totalRNAisolatedfrommousetail—tipfibroblastsTTF),inducedhepatocyte1ikecells(iHep),andprimaryhepatocytes(pHep)SeveraldifferentiallyexpressedmicroRNAswerevalidatedbyquantitativerealtimeRT—PCRAmongtheup—regulatedmicroRNAsin
9、iHepcellswastheliverspecificmiR122whichaccountsformorethan70%ofallmicroRNAsinadultliverSeveralothermicroRNAsaresignificantlydownregulatedafterconversiontoiHepcellsWevalidateddownregulationofmiR34family,miR143/145,miR199a
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