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文檔簡(jiǎn)介
1、本研究以青海高寒草原鄉(xiāng)土植物梭羅草(Kengyilia thoroldiana)為主要研究材料,并與近緣物種大穎草(K. grandiglumis)、糙毛以禮草(K. hirsuta)、疏花以禮草(K. laxiflora)和硬桿以禮草(K. rigidula)進(jìn)行對(duì)比,建立并優(yōu)化梭羅草的擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)反應(yīng)體系,通過(guò) AFLP分子標(biāo)記技術(shù)分析梭
2、羅草的居群間及個(gè)體間的多樣化水平,構(gòu)建梭羅草的AFLP指紋圖譜。研究結(jié)果如下:
利用梭羅草基因組DNA優(yōu)化并建立的梭羅草AFLP反應(yīng)體系為:預(yù)擴(kuò)增反應(yīng)體系(25μl):連接產(chǎn)物1μl;10×PCRBuffer2.5μl;dNTPs0.375μl;Mg2+1μl;TaqDNA聚合酶0.5μl;EcoR I預(yù)擴(kuò)引物1μl;Mse I預(yù)擴(kuò)引物1.2μl;ddH2O加至25μl。選擴(kuò)增反應(yīng)體系(25μl):預(yù)擴(kuò)產(chǎn)物(稀釋20倍)2.0
3、μl,10×PCRBuffer2.5μl;dNTPs0.60μl;Mg2+2μl;TaqDNA聚合酶0.1μl;EcoR I選擴(kuò)引物1.5μl;Mse I選擴(kuò)引物2.5μl;ddH2O加至25μl。
利用優(yōu)化后的AFLP體系,用216對(duì)E/M組合的引物對(duì)梭羅草(8個(gè)居群)和大穎草、疏花以禮草各1個(gè)居群共10份供試材料進(jìn)行了引物篩選,篩選出了38對(duì)具有多態(tài)性的引物,其中6對(duì)擴(kuò)增條帶清晰,鑒別效率高,用這6對(duì)引物構(gòu)建了梭羅草的指紋
4、圖譜。引物組合E16C4和E4C10的擴(kuò)增條帶中均有梭羅草的特征條帶,可用于梭羅草的種質(zhì)鑒定和純度鑒定。組合 E16C4、E3C16擴(kuò)增出的8個(gè)多態(tài)性條帶可以將10份供試材料彼此區(qū)分。
利用AFLP技術(shù)對(duì)12個(gè)梭羅草居群和4個(gè)近緣草種居群進(jìn)行遺傳多樣性研究。用38對(duì)AFLP引物對(duì)16個(gè)居群進(jìn)行遺傳多樣性分析,擴(kuò)增出122個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)。12個(gè)梭羅草居群間的遺傳同一性變異范圍為0.6837-0.8859,遺傳距離變異范圍為0.12
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