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文檔簡介
1、MicroRNA(miRNA)是一類長為20~24nt的單鏈非編碼小分子RNA,主要存在于真核生物中,具有組織特異性、無開放閱讀框等特點,在轉(zhuǎn)錄或翻譯水平調(diào)控基因表達,參與細胞增殖、分化、凋亡,并與炎癥、腫瘤等疾病的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)。環(huán)境毒理學研究表明,當生物細胞或組織暴露于環(huán)境化學物質(zhì)時,會引起相關(guān)miRNA的表達發(fā)生變化,進而導致其靶基因表達發(fā)生變化。因此,有必要明確環(huán)境化學物質(zhì)、miRNA及其靶基因三者間的作用關(guān)系。在環(huán)境毒理學
2、研究和環(huán)境監(jiān)測中,miRNA可作為識別環(huán)境中化學物質(zhì)基因毒性和致癌性的生物標記物,并可用于預測環(huán)境化學物質(zhì)對生物體的毒性。
課題組使用基因芯片方法研究了三唑磷微乳劑、氟蟲腈微乳劑及兩者的混合物對斑馬魚(Daniorerio)miRNA表達的影響,結(jié)果顯示219條待測miRNA中,21條miRNA表達發(fā)生了變化,其中氟蟲腈作用可導致斑馬魚miR-155的顯著下調(diào)。在本研究中,我們通過生物信息學方法,預測cyb561d2為miR-
3、155的一條潛在靶基因,而cyb561d2是細胞色素b561的家族成員,主要功能為跨膜電子傳遞、抗環(huán)血酸的再生和平衡并參與細胞防御以及應答環(huán)境化學物質(zhì)的刺激。
我們將斑馬魚暴露于不同濃度的氟蟲腈中,通過熒光定量PCR發(fā)現(xiàn),隨著氟蟲腈處理濃度從0.015mg/L提高到0.480mg/L,斑馬魚miR-155表達量持續(xù)下調(diào),從0.96下調(diào)至0.24,而cyb561d2表達量則從1.94倍升高至4.17倍;采用Westernblot
4、檢測cyb561d2蛋白表達量,隨著氟蟲腈處理濃度從0.015mg/L提高到0.480mg/L,其表達量從1.46倍升高至3.45倍。
為驗證信息學手段的預測結(jié)果,并解釋氟蟲腈處理的共表達變化,我們成功構(gòu)建四種重組海腎熒光素酶載體;1)包含全長3’-UTR序列;2)僅包含miR-155推定結(jié)合位點及其鄰近核苷酸序列;3)包含3個首尾串聯(lián)的miR-155推定結(jié)合位點序列;4)包含敲除miR-155推定結(jié)合位點的3’-UTR序列,
5、并分別與pGL3-control、miR-155mimic共轉(zhuǎn)染進入293T細胞,利用雙熒光素酶報告基因法驗證了斑馬魚cyb561d2的3’-UTR存在miR-155直接結(jié)合位點,為miR-155的靶基因。
為明確斑馬魚miR-155對cyb561d2基因以及cyb561d2蛋白的負向調(diào)控作用,我們通過轉(zhuǎn)染化學合成的miR-155mimic及可以抑制內(nèi)源性miR-155表達的miR-155inhibitor,引起斑馬魚胚胎細胞
6、ZF4內(nèi)miR-155的異位表達,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)染miR-155mimic的實驗組,cyb561d2mRNA的表達水平僅為陰性對照組的0.29,其蛋白表達水平為陰性對照組的0.61,均顯著下調(diào);而轉(zhuǎn)染miR-155inhibotor的實驗組,其cyb561d2mRNA的表達水平則是對照組的7.71倍,其蛋白表達水平為陰性對照組的2.78倍,均顯著上調(diào)。
為明確斑馬魚miR-155對氟蟲腈作用下ZF4細胞增殖的影響,我們使用MTT法測定
7、了斑馬魚ZF4細胞氟蟲腈暴露的IC50值為17.1mg/L,并研究了異位表達的miR-155對處于IC50氟蟲腈濃度暴露下的斑馬魚細胞的增殖及存活率的影響,發(fā)現(xiàn)miR-155顯著降低了ZF4細胞的增殖及存活率,而抑制內(nèi)源miR-155的表達,則可以顯著增強細胞的增殖及存活率。因此,miR-155可作為暴露于氟蟲腈環(huán)境的生物標志物。
考慮到miRNA與其靶基因不是一一對應的關(guān)系,我們通過生物信息學軟件預測到斑馬魚cyb561d2
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