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文檔簡(jiǎn)介
1、研究目的
1.篩選小細(xì)胞肺癌中干細(xì)胞與非干細(xì)胞差異表達(dá)的關(guān)鍵miRNAs。
2.探討關(guān)鍵miRNAs對(duì)H446細(xì)胞體外自我更新能力的影響。
研究方法
1.課題組前期工作證明小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系H446腫瘤球中富集了干細(xì)胞樣細(xì)胞。本實(shí)驗(yàn)通過無血清培養(yǎng)技術(shù)在小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系H446、H209和H69中獲得第四代腫瘤球細(xì)胞。
2.利用microRNA芯片技術(shù),檢測(cè)小細(xì)胞肺癌細(xì)胞
2、系中干細(xì)胞和非干細(xì)胞的microRNA表達(dá)譜,篩選出兩群細(xì)胞中差異表達(dá)的miRNAs。
3.利用miRBase數(shù)據(jù)庫(kù),分析差異表達(dá)miRNAs的種子序列。
4.根據(jù)較大差異倍數(shù)及其他篩選策略進(jìn)一步篩選miRNAs。
5.應(yīng)用qRT-PCR方法,在上述三個(gè)細(xì)胞系的干細(xì)胞和非干細(xì)胞中驗(yàn)證其表達(dá),并選定三個(gè)細(xì)胞系中恒定差異表達(dá)的miRNAs作為關(guān)鍵miRNAs。
6.利用轉(zhuǎn)染技術(shù),降低或
3、升高關(guān)鍵miRNAs的表達(dá)水平后,進(jìn)行腫瘤球形成、克隆形成和MTT實(shí)驗(yàn),了解關(guān)鍵miRNA對(duì)H446細(xì)胞體外自我更新和增殖的影響;通過免疫熒光染色,檢測(cè)uPAR和CK的表達(dá),了解其對(duì)細(xì)胞分化的影響。
7.利用miRNA靶基因預(yù)測(cè)軟件,分析關(guān)鍵miRNA和一些種子序列相同的重要miRNAs可能調(diào)控的靶基因,篩選出調(diào)控細(xì)胞增殖、凋亡和細(xì)胞周期的靶基因。
結(jié)果
1.小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系H446干細(xì)胞與非干
4、細(xì)胞的miRNA表達(dá)譜microRNA芯片結(jié)果顯示:第四代腫瘤球細(xì)胞和親代細(xì)胞之間相比,有86個(gè)差異表達(dá)的miRNAs(P<0.01),其中48個(gè)miRNAs表達(dá)上調(diào),38個(gè)miRNAs表達(dá)下調(diào)。
2.小細(xì)胞肺癌干細(xì)胞與非干細(xì)胞差異表達(dá)的關(guān)鍵miRNA
(1)差異表達(dá)miRNAs的種子序列分析:鑒于miRNAs的種子序列直接介導(dǎo)miRNAs與其靶基因的相互作用,因此,我們進(jìn)一步分析了上述86個(gè)差異表達(dá)miRN
5、As的種子序列,并將具有相同種子序列的miRNAs歸為一組。結(jié)果顯示:86個(gè)miRNAs中具有相同種子序列的miRNAs有29個(gè),共組成9組。
(2)進(jìn)一步篩選miRNAs:86個(gè)差異表達(dá)的miRNAs中,根據(jù)上述篩選策略,篩選出6個(gè)miRNAs,其中l(wèi)et-7、miR-20、miR-21、miR-27a和miR-30b表達(dá)下調(diào),miR-149*表達(dá)上調(diào)。
(3)驗(yàn)證并最后選定關(guān)鍵miRNAs: qRT-PC
6、R結(jié)果顯示6個(gè)miRNAs在三個(gè)細(xì)胞系的腫瘤球細(xì)胞和親代細(xì)胞之間的表達(dá)水平確有差異,證實(shí)了microRNA芯片結(jié)果;但是,僅miR-27a在三個(gè)細(xì)胞系的腫瘤球中恒定低表達(dá),其余5個(gè)miRNAs在三個(gè)細(xì)胞系的腫瘤球中表達(dá)趨勢(shì)不一致。
3.miR-27a調(diào)控H446細(xì)胞體外自我更新
(1) miR-27a下調(diào)增加腫瘤球形成和克隆形成:在親代細(xì)胞H446中轉(zhuǎn)染miR-27a抑制劑下調(diào)miR-27a的表達(dá),體外無血清
7、成球?qū)嶒?yàn)和克隆形成實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示:轉(zhuǎn)染miR-27a抑制劑的細(xì)胞形成更多的腫瘤球和細(xì)胞集落。就形態(tài)而言,轉(zhuǎn)染miR-27a抑制劑組形成的腫瘤球更大。
(2) miR-27a下調(diào)增強(qiáng)細(xì)胞增殖:轉(zhuǎn)染miR-27a抑制劑和陰性對(duì)照后,通過MTT實(shí)驗(yàn)觀察不同時(shí)間點(diǎn)的細(xì)胞活力,結(jié)果顯示:轉(zhuǎn)染miR-27a抑制劑的細(xì)胞在轉(zhuǎn)染后48 h和72 h,細(xì)胞活力明顯高于轉(zhuǎn)染陰性對(duì)照的細(xì)胞。
(3) miR-27a下調(diào)抑制細(xì)胞分化:
8、將轉(zhuǎn)染miR-27a抑制劑和陰性對(duì)照的細(xì)胞培養(yǎng)72 h后進(jìn)行免疫熒光染色,結(jié)果顯示:轉(zhuǎn)染miR-27a抑制劑顯著增加了uPAR+細(xì)胞和CK-細(xì)胞的數(shù)目。
4.靶基因預(yù)測(cè)
通過miRNAs靶基因預(yù)測(cè)軟件TargetScan5.1(http://www.targetscan.org/),篩選出了與細(xì)胞增殖、凋亡以及細(xì)胞周期相關(guān)的基因。如miR-27a調(diào)節(jié)的與細(xì)胞增殖、凋亡以及細(xì)胞周期相關(guān)的靶基因有BCLAF1、B
9、AK1和CCNG1,miR-27b調(diào)控的與細(xì)胞增殖、凋亡以及細(xì)胞周期相關(guān)靶基因有BAK1和CCNG1。
結(jié)論
1.小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系H446干細(xì)胞和非干細(xì)胞的miRNAs表達(dá)存在差異。
2.miR-27a是小細(xì)胞肺癌干細(xì)胞的關(guān)鍵miRNA,低水平的miR-27a可能是小細(xì)胞肺癌干細(xì)胞的內(nèi)在特征。
3.miR-27a下調(diào)增加H446細(xì)胞體外自我更新能力,降低細(xì)胞分化。
總
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